49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35990 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  707    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  34.65 
 
 		 351 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  37.85 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  113  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  29.89 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  34.6 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  34.14 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  30.61 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  28.47 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  27.12 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  33.6 
 
 		 321 aa  99.8  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  29.79 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  31.33 
 
 		 290 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  27.96 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  34.22 
 
 		 372 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  33.2 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  31.42 
 
 		 293 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  28.23 
 
 		 343 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  31.4 
 
 		 392 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  29.31 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  31.1 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  28.83 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  32.32 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  27.48 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  27.53 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  28.21 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  28.62 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  29.35 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  29.32 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  27.27 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  26.63 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  29.79 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  32.92 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  35.9 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  27.64 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  25.82 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  33.59 
 
 		 411 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  34.19 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  25.17 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  26.38 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  40 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  27.06 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  26.1 
 
 		 402 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  27.59 
 
 		 363 aa  49.7  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  28.34 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.23 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.713533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  29.53 
 
 		 393 aa  46.6  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>