105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17440 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_17440  Lauroyl/myristoyl acyltransferase  100 
 
 
317 aa  631  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0985707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  55.63 
 
 
318 aa  350  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.015073  normal  0.0495173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1786  lipid A biosynthesis acyltransferase  57.1 
 
 
337 aa  318  9e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  normal  0.0660981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1659  lipid A biosynthesis acyltransferase  56.29 
 
 
326 aa  318  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1982  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  53.53 
 
 
328 aa  277  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.859869  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  44.7 
 
 
311 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0505202  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  45.23 
 
 
320 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  40.6 
 
 
307 aa  205  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  44.13 
 
 
304 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  45.79 
 
 
404 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  39.8 
 
 
304 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.1 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  41.78 
 
 
310 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2344  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  39.46 
 
 
355 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  37.92 
 
 
317 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  37.21 
 
 
314 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2102  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  40.74 
 
 
307 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.995802  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  40.07 
 
 
328 aa  169  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1363  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  37.84 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.698598  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  36.54 
 
 
307 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  36.54 
 
 
307 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  36.54 
 
 
307 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2406  lipid A biosynthesis acyltransferase  38.41 
 
 
300 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.96 
 
 
286 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  37.87 
 
 
310 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12630  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  38.52 
 
 
316 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.86 
 
 
303 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3185  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.05 
 
 
335 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.83 
 
 
342 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2290  lipid A biosynthesis acyltransferase  37.99 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146974  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.61 
 
 
234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.41 
 
 
290 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.78 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.82 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.06 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3368  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.78 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00130747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.72 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.91 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.9 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.81 
 
 
301 aa  63.9  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.44 
 
 
281 aa  63.5  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  22 
 
 
294 aa  62.8  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.43 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.4 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.11 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.58 
 
 
312 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  24.07 
 
 
281 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.27 
 
 
303 aa  59.7  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  24.07 
 
 
281 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1676  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.58 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.480087  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  24.51 
 
 
306 aa  57  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  24.6 
 
 
307 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  17.11 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.49 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.56 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.62 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.53 
 
 
299 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.74 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1222  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.65 
 
 
308 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413151  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.53 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.35 
 
 
295 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.71 
 
 
331 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1368  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.4 
 
 
290 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.17 
 
 
284 aa  52.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  25.71 
 
 
304 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.6 
 
 
293 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.05 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  24.8 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  16.67 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  16.67 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.14 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.82 
 
 
340 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  21.33 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.57 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4887  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.71 
 
 
289 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231299  normal  0.44297 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.89 
 
 
297 aa  50.1  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.68 
 
 
296 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.63 
 
 
289 aa  49.3  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5430  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  33.11 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5158  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.8 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  24 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.8 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.03 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1946  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  32.89 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.2 
 
 
295 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.88 
 
 
287 aa  47.8  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00120  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.26 
 
 
295 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.4 
 
 
302 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  16.59 
 
 
290 aa  47  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.74 
 
 
300 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1502  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.69 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
288 aa  46.2  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2621  lipid A biosynthesis acyltransferase  18.33 
 
 
305 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.73 
 
 
453 aa  45.8  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1078  lauroyl/myristoyl acyltransferase  19.2 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1414  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.05 
 
 
314 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0185573  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.16 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2901  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.05 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.66 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>