More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16710 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_16710  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 554 aa  1111    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0521739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  35.5 
 
 		 551 aa  282  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0866  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 555 aa  267  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2879  histidine kinase  35.37 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 575 aa  253  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 587 aa  253  9.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08080  signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 569 aa  237  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.672311  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27560  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 597 aa  228  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.972218  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35660  signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 572 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  33.2 
 
 		 535 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  32.49 
 
 		 549 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2855  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 712 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 625 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 589 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 581 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 596 aa  159  9e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 587 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 607 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 590 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 584 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 584 aa  153  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 582 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2895  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 539 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939958  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 590 aa  150  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  39.19 
 
 		 537 aa  148  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 637 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 656 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4318  ATPase domain-containing protein  41.36 
 
 		 593 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819924  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0339  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 		 579 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 885 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 2153 aa  147  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 600 aa  147  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 576 aa  146  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  38.2 
 
 		 589 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  38.16 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 587 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 		 666 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 566 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 		 666 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  32.79 
 
 		 587 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 585 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  32.79 
 
 		 587 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  32.79 
 
 		 587 aa  145  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  33.06 
 
 		 587 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  32.79 
 
 		 587 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  32.79 
 
 		 587 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 489 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  32.79 
 
 		 587 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 1010 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  33.06 
 
 		 587 aa  144  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  33.06 
 
 		 587 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.21 
 
 		 889 aa  143  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 589 aa  143  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 608 aa  143  9e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 473 aa  143  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 827 aa  143  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 958 aa  143  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 585 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 1033 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  34.33 
 
 		 591 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 672 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  25.99 
 
 		 446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 563 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 634 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  40.61 
 
 		 363 aa  140  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 682 aa  140  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 815 aa  140  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 612 aa  140  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 412 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 466 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108097  normal  0.083954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 587 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 590 aa  139  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 460 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 		 663 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 		 701 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 920 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 		 664 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 608 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 1029 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 763 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  38.7 
 
 		 676 aa  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 765 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  27.62 
 
 		 465 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  32.2 
 
 		 745 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 584 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  32.74 
 
 		 461 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  32.74 
 
 		 463 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 492 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0351302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  32.74 
 
 		 463 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  34.85 
 
 		 346 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  32.74 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 595 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  36.49 
 
 		 352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>