More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08650 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  100 
 
 		 606 aa  1191    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  47.01 
 
 		 626 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  33.01 
 
 		 594 aa  266  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  36.03 
 
 		 599 aa  260  6e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  33.87 
 
 		 611 aa  260  6e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  31.28 
 
 		 625 aa  254  5.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  35.11 
 
 		 628 aa  253  9.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  33.33 
 
 		 583 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  29.88 
 
 		 614 aa  251  4e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  32.31 
 
 		 600 aa  249  8e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  33.14 
 
 		 605 aa  247  4.9999999999999997e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  28 
 
 		 599 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  37.55 
 
 		 596 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  33.4 
 
 		 600 aa  243  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  27.86 
 
 		 571 aa  240  5e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  33 
 
 		 603 aa  239  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  32.52 
 
 		 600 aa  239  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  35.79 
 
 		 596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  36.46 
 
 		 586 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  29.44 
 
 		 610 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  36.46 
 
 		 585 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  32.37 
 
 		 568 aa  229  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  31.5 
 
 		 603 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  36.87 
 
 		 583 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.93 
 
 		 564 aa  220  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.62 
 
 		 564 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.62 
 
 		 564 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  29.46 
 
 		 613 aa  213  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  26.24 
 
 		 599 aa  209  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  26.98 
 
 		 564 aa  207  6e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  32.68 
 
 		 607 aa  206  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.95 
 
 		 601 aa  204  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  25.76 
 
 		 601 aa  203  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  29.88 
 
 		 599 aa  200  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  31.39 
 
 		 610 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  27.18 
 
 		 586 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  26.64 
 
 		 611 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  26.43 
 
 		 611 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  43.59 
 
 		 589 aa  193  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  28.29 
 
 		 586 aa  193  8e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  34.3 
 
 		 625 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  25.43 
 
 		 610 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  28.36 
 
 		 612 aa  189  9e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  27.59 
 
 		 572 aa  187  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  42.13 
 
 		 590 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  29.96 
 
 		 676 aa  184  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  36.1 
 
 		 594 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  45.02 
 
 		 589 aa  183  9.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  23.73 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  43.86 
 
 		 592 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  41.2 
 
 		 582 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2917  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  41.35 
 
 		 576 aa  182  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0964  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  44.07 
 
 		 601 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.519828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1979  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  43.97 
 
 		 589 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  42.55 
 
 		 594 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  43.1 
 
 		 574 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.08 
 
 		 600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  38.28 
 
 		 597 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  43.1 
 
 		 574 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.86 
 
 		 590 aa  181  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  43.57 
 
 		 581 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  25.67 
 
 		 576 aa  180  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  40.43 
 
 		 597 aa  180  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  35.18 
 
 		 651 aa  179  9e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.83 
 
 		 582 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.83 
 
 		 582 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.83 
 
 		 582 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  41.53 
 
 		 596 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.83 
 
 		 582 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  37.37 
 
 		 600 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.83 
 
 		 582 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1255  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  42.4 
 
 		 597 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261223  normal  0.738985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2054  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.32 
 
 		 593 aa  178  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  40.43 
 
 		 582 aa  177  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  39.42 
 
 		 584 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  29.8 
 
 		 613 aa  177  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  43.75 
 
 		 746 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  39.04 
 
 		 595 aa  177  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.43 
 
 		 587 aa  177  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  40.09 
 
 		 580 aa  177  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  42.41 
 
 		 583 aa  177  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  41.81 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  41.81 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  41.81 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  41.81 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  29.07 
 
 		 638 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  41.81 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  41.81 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  41.81 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  41.81 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.27 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  41.81 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2226  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  43.5 
 
 		 593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  40.43 
 
 		 588 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  42.17 
 
 		 597 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2346  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  43.5 
 
 		 583 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  43.17 
 
 		 610 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  38.43 
 
 		 596 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  40.98 
 
 		 582 aa  174  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  34.35 
 
 		 737 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>