More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05100 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_05100  protein-tyrosine-phosphatase  100 
 
 
151 aa  315  1e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1597  protein tyrosine phosphatase  61.64 
 
 
158 aa  197  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000018039 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1162  protein tyrosine phosphatase  53.64 
 
 
166 aa  173  6e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000163981  hitchhiker  0.000000530383 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1040  protein tyrosine phosphatase  42.57 
 
 
155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1164  protein-tyrosine-phosphatase  37.84 
 
 
158 aa  122  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000978819  hitchhiker  1.39991e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  41.1 
 
 
155 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.67 
 
 
154 aa  107  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  34.46 
 
 
156 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.67 
 
 
154 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  36.67 
 
 
154 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  36.67 
 
 
154 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.67 
 
 
154 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  37.84 
 
 
162 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.67 
 
 
154 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36.67 
 
 
154 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36 
 
 
154 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1274  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.45 
 
 
151 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  36 
 
 
154 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0467  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  32.45 
 
 
151 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000118337  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1394  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.79 
 
 
151 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.560214  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  37.58 
 
 
158 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2514  protein tyrosine phosphatase  36.99 
 
 
145 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.714976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  35.33 
 
 
154 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  37.91 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4584  protein tyrosine phosphatase  34.46 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000111073  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  33.55 
 
 
175 aa  97.4  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0387  protein tyrosine phosphatase  35.42 
 
 
172 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  35.14 
 
 
162 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  37.58 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 
158 aa  94.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1419  phosphotyrosine protein phosphatase  32.21 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1125  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30 
 
 
154 aa  92  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 
164 aa  92  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  35.76 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 
166 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  35.76 
 
 
160 aa  90.5  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0240  protein tyrosine phosphatase  32.61 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1935  protein tyrosine phosphatase  31.54 
 
 
154 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.498684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1969  protein-tyrosine-phosphatase  31.54 
 
 
154 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.216833  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  32.67 
 
 
165 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  38.1 
 
 
150 aa  88.2  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  34.87 
 
 
182 aa  87.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  32.43 
 
 
165 aa  87  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  37.01 
 
 
172 aa  86.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  34.23 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  34.87 
 
 
175 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  31.03 
 
 
188 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  32.68 
 
 
163 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  31.18 
 
 
182 aa  84.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0817  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  31.29 
 
 
186 aa  85.1  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.183565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  32.52 
 
 
178 aa  84.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3252  protein tyrosine phosphatase  32.67 
 
 
168 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  hitchhiker  0.000187254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  31.79 
 
 
173 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1912  protein-tyrosine phosphatase  34.9 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.272443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  34.01 
 
 
154 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.67 
 
 
453 aa  82.8  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.44 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  32.43 
 
 
161 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  35.48 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.44 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.44 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  33.55 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.44 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.44 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.44 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  34.44 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  32.43 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  34.11 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  34.13 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  30.95 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  35.67 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  32.85 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  35.1 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  34.93 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  31.17 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  30.13 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  31.79 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0050  phosphotyrosine protein phosphatase, low molecular weight  34.23 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00169235  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  29.49 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  32.45 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  32.64 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.76 
 
 
160 aa  77  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  31.79 
 
 
166 aa  77  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  30 
 
 
152 aa  77  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  31.76 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  30.52 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.07 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  35.26 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  29.61 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  35.16 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>