63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05050 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  100 
 
 		 457 aa  952    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  41.82 
 
 		 440 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  41.33 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  37.18 
 
 		 417 aa  279  6e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  39.12 
 
 		 435 aa  276  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  37.17 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  27.7 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 343 aa  92  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 380 aa  87  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 371 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 		 350 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 		 371 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  28.57 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  25.64 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  25.78 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  25 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 		 343 aa  55.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  29.23 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 331 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 331 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.84 
 
 		 235 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  37.27 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1357  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.84 
 
 		 235 aa  50.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.38 
 
 		 325 aa  50.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0195901 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  29.13 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0710  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0024  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.31 
 
 		 309 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0058  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.55 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0683  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 388 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  23.12 
 
 		 565 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3384  Radical SAM domain protein  31.91 
 
 		 313 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.06 
 
 		 373 aa  47  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2836  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.39 
 
 		 381 aa  47  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  35.23 
 
 		 649 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  34.68 
 
 		 608 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4990  radical SAM family protein  31.51 
 
 		 386 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.396764  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04770  ribonucleoside-triphosphate reductase class III activase subunit  27.17 
 
 		 179 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0269333  normal  0.584897 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  25.49 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1279  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 		 327 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000563551 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.09 
 
 		 308 aa  45.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.18 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1669  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.75 
 
 		 321 aa  45.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1101  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.91 
 
 		 310 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5946  molybdopterin biosynthesis, protein A  33.04 
 
 		 331 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302426  normal  0.0104705 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 		 251 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 341 aa  44.3  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4663  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0193587 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 		 332 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.84 
 
 		 329 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  24.13 
 
 		 334 aa  43.5  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.09 
 
 		 298 aa  43.5  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.01 
 
 		 372 aa  43.5  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.150744  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.11 
 
 		 293 aa  43.5  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>