More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4086 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_4086  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
235 aa  474  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.157034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  32.19 
 
 
460 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0517  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
496 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  26.54 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
409 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
421 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
416 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.57 
 
 
402 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
326 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  25.36 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
437 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1357  hypothetical protein  25.97 
 
 
388 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  23.81 
 
 
574 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  29.06 
 
 
435 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
321 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
312 aa  62  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1361  hypothetical protein  26.01 
 
 
388 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14980  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00134453  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  25.88 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
412 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 
597 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  21.79 
 
 
262 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  27.75 
 
 
428 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
378 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1630  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.54 
 
 
253 aa  59.7  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 
414 aa  59.7  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
441 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
251 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
251 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0154  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
268 aa  58.9  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
422 aa  58.5  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
320 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14090  glycosyl transferase  25 
 
 
264 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0593643  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
337 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
320 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  25 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0825  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  25.59 
 
 
406 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  28.11 
 
 
425 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
333 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
430 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
235 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
386 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
295 aa  55.8  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.97 
 
 
248 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
262 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.34 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04947  hypothetical protein similar to dolichol phosphate mannose synthase (Eurofung)  25.1 
 
 
244 aa  55.5  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0356269  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 
380 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  29.17 
 
 
389 aa  55.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1592  putative glycosyl transferase  30.38 
 
 
339 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
261 aa  55.1  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
266 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
342 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.94 
 
 
305 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  23.45 
 
 
313 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  25.91 
 
 
298 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  24.27 
 
 
883 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  23.04 
 
 
245 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.09 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  24.71 
 
 
347 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
331 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  23.42 
 
 
338 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2295  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
376 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 
318 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
276 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 
329 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  24.28 
 
 
337 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 
338 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
389 aa  52.4  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  27.33 
 
 
313 aa  52.4  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  23.41 
 
 
336 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  23.02 
 
 
336 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>