More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3193 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3193  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
345 aa  691    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.558162  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0813  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278172 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0315  glycosyl transferase family 9  35.48 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  36.64 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.22 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.93 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  24.2 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
475 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2797  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
386 aa  69.3  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.33 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  39.84 
 
 
392 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.41 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.77 
 
 
516 aa  65.9  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1967  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  36.67 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0576  heptosyltransferase  36.67 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0669  heptosyltransferase  36.67 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822838  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  34.62 
 
 
367 aa  63.5  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  32.48 
 
 
385 aa  63.5  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.9 
 
 
356 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
409 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.04 
 
 
359 aa  63.2  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 
379 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.9 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.9 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.9 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1978  lipopolysaccharide heptosyltransferase II rfaC2  29.89 
 
 
402 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.5 
 
 
390 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  34.21 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.9 
 
 
356 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.61 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3671  glycosyl transferase family 9  32.72 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16025  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2230  glycosyl transferase family protein  38.35 
 
 
330 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0384133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  36 
 
 
352 aa  60.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.25 
 
 
361 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.07 
 
 
356 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
335 aa  59.3  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  30.09 
 
 
350 aa  59.3  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0811  glycosyl transferase family 9  34.55 
 
 
331 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513636  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  33.86 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.33 
 
 
366 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  23.8 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  33.86 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0749  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  30.77 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  29.85 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  33.86 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  33.86 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  33.86 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  32.74 
 
 
458 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  35.65 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  33.86 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.9 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.19 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.02 
 
 
352 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  27.73 
 
 
344 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  33.33 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.63 
 
 
352 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  30.19 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.59 
 
 
352 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.59 
 
 
352 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0778  glycosyl transferase family 9  31.09 
 
 
369 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0843  glycosyl transferase family 9  35.11 
 
 
420 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0221894 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0068  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  33.06 
 
 
321 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4148  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  33.06 
 
 
321 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0062  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  33.06 
 
 
321 aa  57  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0223597  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3011  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
381 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169965  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.59 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.67 
 
 
327 aa  56.2  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1807  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 
362 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.987193  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0312  glycosyl transferase family 9  33.1 
 
 
574 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0976  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 
315 aa  56.2  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0610  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  36 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.93 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2523  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
549 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0027494  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.64 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  29.31 
 
 
370 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  32.56 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  21.05 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.06 
 
 
359 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.64 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3948  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  34.26 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  25.23 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.73 
 
 
356 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  27.33 
 
 
362 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3802  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 
403 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0801  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.35 
 
 
335 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>