155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2949 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2949  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 183 aa  373  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0479  ACT domain-containing protein  46.99 
 
 		 183 aa  167  8e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1965  ACT domain-containing protein  45.9 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3703  glycine cleavage system regulatory protein-like  44.81 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0621  amino acid-binding ACT domain protein  41.62 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3457  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  37.5 
 
 		 185 aa  98.2  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3496  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.52 
 
 		 181 aa  91.3  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3554  amino acid-binding ACT  33.33 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0217681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4055  amino acid-binding ACT domain protein  33.14 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3514  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.74 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3969  amino acid-binding ACT domain protein  32.54 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100488  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  31.82 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2533  glycine cleavage system regulatory protein  31.21 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4386  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.36 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523733  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4707  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4333  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0493  amino acid-binding ACT domain protein  28.25 
 
 		 165 aa  72  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0278  amino acid-binding ACT domain protein  26.97 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.305725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0527  amino acid-binding ACT domain protein  29.17 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2199  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.48 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0596072  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2002  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.42 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2118  hypothetical protein  36.17 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0437  ACT domain protein  31.13 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0599  amino acid-binding ACT domain protein  31.13 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4273  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.71 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340897  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1150  cellulose-binding family II protein  25 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.768713 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05930  ACT domain-containing regulatory protein  32.54 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000527553  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1534  hypothetical protein  38.46 
 
 		 90 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1378  hypothetical protein  42.11 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000129759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0612  hypothetical protein  35.35 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1671  hypothetical protein  46.48 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0230  hypothetical protein  39.47 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.867874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03152  ACT domain protein  24.71 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0918  hypothetical protein  46.38 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0844317  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1270  hypothetical protein  45.07 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0826  amino acid-binding ACT domain protein  25.15 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.892136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4173  formyl transferase-like  29.71 
 
 		 385 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  25.29 
 
 		 417 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2479  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.07 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  25.29 
 
 		 417 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  25.29 
 
 		 417 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1683  hypothetical protein  38.16 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  21.58 
 
 		 405 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0944  hypothetical protein  36.25 
 
 		 90 aa  57.4  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0332  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.29 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3182  hypothetical protein  32.63 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  hitchhiker  0.00106731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06310  ACT domain-containing protein  25 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183389  normal  0.204088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5182  ACT domain-containing protein  29.03 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248291  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14440  hypothetical protein  31.87 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0587  hypothetical protein  24.14 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000555119  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0411  amino acid-binding ACT domain protein  25.29 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3283  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2075  ACT domain-containing protein  39.76 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0122  ACT domain-containing protein  37.18 
 
 		 89 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8574  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  29.33 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  24.35 
 
 		 404 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0439  ACT domain-containing protein  36.49 
 
 		 89 aa  53.5  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0941  ACT domain-containing protein  36.36 
 
 		 88 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0440922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1354  hypothetical protein  37.33 
 
 		 93 aa  53.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0481  ACT domain protein  23.67 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000098406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1747  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0169419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4699  amino acid-binding ACT  28.48 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000305264  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  25.57 
 
 		 400 aa  52  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1034  hypothetical protein  36.11 
 
 		 90 aa  52  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1723  hypothetical protein  33.68 
 
 		 89 aa  52  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0409  hypothetical protein  30.34 
 
 		 89 aa  51.6  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.168136  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2985  amino acid-binding ACT domain protein  27.88 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2117  hypothetical protein  38.16 
 
 		 90 aa  51.2  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1181  hypothetical protein  36.11 
 
 		 92 aa  50.8  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.254415  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2176  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.16 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00808907  normal  0.900227 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2032  amino acid-binding ACT domain protein  31.17 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169147  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1017  ACT domain-containing protein  35.9 
 
 		 95 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.890596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1847  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.12 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00121314  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0587  hypothetical protein  32.47 
 
 		 90 aa  50.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1470  hypothetical protein  40.79 
 
 		 112 aa  50.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.461191  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2798  hypothetical protein  41.67 
 
 		 90 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019428  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18740  glycine cleavage system regulatory protein  30.11 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.960027  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2005  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.388818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  24.08 
 
 		 404 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4845  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.03 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2229  amino acid-binding ACT domain protein  28.16 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0964148 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2525  glycine cleavage system transcriptional repressor  23.86 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1136  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.49 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2431  amino acid-binding ACT domain-containing protein  21.14 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0267912  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  24.08 
 
 		 415 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1126  hypothetical protein  40.79 
 
 		 100 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0829  hypothetical protein  32.98 
 
 		 92 aa  48.9  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1499  ACT domain-containing protein  40.28 
 
 		 90 aa  48.9  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2658  hypothetical protein  45.61 
 
 		 90 aa  48.5  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1734  glycine cleavage system transcriptional repressor, putative  22.41 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0758  hypothetical protein  34.72 
 
 		 108 aa  48.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.140436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  23.56 
 
 		 404 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3885  ACT domain-containing protein  25.84 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  21.69 
 
 		 404 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  21.65 
 
 		 406 aa  47.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2268  hypothetical protein  47.92 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3180  glycine cleavage system transcriptional repressor  27.44 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0342  ACT domain-containing protein  34.62 
 
 		 90 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1943  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.75 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0970  hypothetical protein  38.89 
 
 		 90 aa  47.4  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1979  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.86 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00211865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>