More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1033 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1033  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 522 aa  1030    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.105478  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1882  integral membrane protein MviN  62.69 
 
 		 527 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2468  integral membrane protein MviN  58.62 
 
 		 529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3067  virulence factor MVIN family protein  56.42 
 
 		 538 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0736  virulence factor MVIN family protein  47.89 
 
 		 537 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4685  virulence factor MVIN family protein  38.96 
 
 		 553 aa  276  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3967  integral membrane protein MviN  35.9 
 
 		 540 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  31.79 
 
 		 523 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  32.85 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  30.82 
 
 		 531 aa  188  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  30.54 
 
 		 514 aa  180  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  30.93 
 
 		 530 aa  172  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  29.16 
 
 		 525 aa  172  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  32.2 
 
 		 524 aa  170  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  29.43 
 
 		 521 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  28.08 
 
 		 523 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  29.12 
 
 		 533 aa  160  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  28.5 
 
 		 523 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  30.7 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  30.7 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 		 514 aa  153  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1495  integral membrane protein MviN  27.36 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  28.86 
 
 		 534 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  25.52 
 
 		 521 aa  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  28.33 
 
 		 613 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  29 
 
 		 529 aa  150  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  31.6 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  31.53 
 
 		 512 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  28.61 
 
 		 522 aa  146  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  31.53 
 
 		 512 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  28.63 
 
 		 541 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  30.15 
 
 		 534 aa  144  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  30.55 
 
 		 512 aa  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  25.69 
 
 		 512 aa  143  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  30.89 
 
 		 535 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  29.79 
 
 		 495 aa  143  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  30.62 
 
 		 535 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  30.99 
 
 		 518 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  30.02 
 
 		 512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  30.97 
 
 		 514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  30.67 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  25.64 
 
 		 549 aa  141  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  29.56 
 
 		 526 aa  141  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  29.4 
 
 		 512 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  25.97 
 
 		 521 aa  140  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  28.27 
 
 		 511 aa  140  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  26.29 
 
 		 516 aa  139  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  27.71 
 
 		 512 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  27.53 
 
 		 511 aa  139  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  27.45 
 
 		 508 aa  139  2e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  29.08 
 
 		 523 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  28.2 
 
 		 512 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  27.38 
 
 		 511 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  29.19 
 
 		 519 aa  136  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  27.38 
 
 		 511 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  30.57 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  27.03 
 
 		 498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  29.36 
 
 		 517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  26.81 
 
 		 511 aa  134  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  27.06 
 
 		 522 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  26.18 
 
 		 521 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 		 521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  27.62 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  29.31 
 
 		 512 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  25.45 
 
 		 516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  30.29 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  30.49 
 
 		 512 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  25.66 
 
 		 542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  24.65 
 
 		 501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  25.7 
 
 		 511 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  25.22 
 
 		 516 aa  131  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  24.82 
 
 		 523 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  25.59 
 
 		 519 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  26.56 
 
 		 511 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  27.38 
 
 		 512 aa  131  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  25.28 
 
 		 524 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  25.28 
 
 		 524 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  25.8 
 
 		 521 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  25.28 
 
 		 524 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  30.98 
 
 		 524 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  25.28 
 
 		 524 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  25.28 
 
 		 524 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  27.94 
 
 		 528 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  25.47 
 
 		 521 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  25.75 
 
 		 511 aa  130  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  27.04 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  26.48 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 		 522 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2971  integral membrane protein MviN  30.05 
 
 		 525 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000053192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0760  virulence factor MVIN-like  29.52 
 
 		 516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  24.71 
 
 		 519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  24.71 
 
 		 519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  26.93 
 
 		 545 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  25.69 
 
 		 524 aa  128  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  27.23 
 
 		 530 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3202  integral membrane protein MviN  29.05 
 
 		 516 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  27.65 
 
 		 521 aa  127  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  27.21 
 
 		 515 aa  127  6e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  25.51 
 
 		 522 aa  126  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1580  virulence factor  29.95 
 
 		 536 aa  126  9e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.716826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>