277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0677 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0677  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 553 aa  1155    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2954  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  33.61 
 
 		 685 aa  292  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.738213  hitchhiker  0.000297505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1063  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  32.93 
 
 		 676 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.218246  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1376  Oxaloacetate decarboxylase  32.53 
 
 		 676 aa  280  5e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.132015  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0417  pyruvate carboxylase  28.99 
 
 		 1234 aa  225  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00734861 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1328  pyruvate carboxylase  28.74 
 
 		 1234 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0515134 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1553  pyruvate carboxylase  28.32 
 
 		 1233 aa  206  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0585647  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2160  pyruvate carboxylase  29.48 
 
 		 1229 aa  205  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2081  pyruvate carboxylase  27.24 
 
 		 1238 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2308  pyruvate carboxylase  27.62 
 
 		 1229 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0873  pyruvate carboxylase  28.52 
 
 		 1230 aa  200  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0690  pyruvate carboxylase  27.88 
 
 		 1230 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775311  normal  0.465507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3925  pyruvate carboxylase subunit B  34.59 
 
 		 602 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5060  pyruvate carboxylase subunit B  31.12 
 
 		 602 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6223  pyruvate carboxylase subunit B  31.72 
 
 		 607 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5639  pyruvate carboxylase subunit B  31.3 
 
 		 602 aa  188  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509278  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4478  pyruvate carboxylase subunit B  30.4 
 
 		 602 aa  187  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5510  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  30.53 
 
 		 602 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02060  pyruvate carboxylase subunit B  30.21 
 
 		 599 aa  187  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1512  pyruvate carboxylase subunit B  35.48 
 
 		 617 aa  187  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.841478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71720  pyruvate carboxylase subunit B  31.52 
 
 		 607 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1916  pyruvate carboxylase subunit B  30.62 
 
 		 609 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.566124  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3376  oxaloacetate decarboxylase  30.51 
 
 		 604 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5395  pyruvate carboxylase subunit B  31.05 
 
 		 602 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5346  pyruvate carboxylase subunit B  31.32 
 
 		 602 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5255  pyruvate carboxylase subunit B  31.32 
 
 		 602 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.594563 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0639  oxaloacetate decarboxylase  30.65 
 
 		 595 aa  184  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5124  pyruvate carboxylase subunit B  30.62 
 
 		 602 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2480  oxaloacetate decarboxylase  28.94 
 
 		 598 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3196  oxaloacetate decarboxylase  30 
 
 		 594 aa  182  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.097101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1052  oxaloacetate decarboxylase  29.31 
 
 		 599 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0474655  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1092  oxaloacetate decarboxylase  29.15 
 
 		 607 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1025  oxaloacetate decarboxylase  28.92 
 
 		 606 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0507  pyruvate carboxylase subunit B  28.31 
 
 		 596 aa  180  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1556  pyruvate carboxylase subunit B  30.45 
 
 		 615 aa  180  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.944098  normal  0.0959021 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1030  oxaloacetate decarboxylase  28.99 
 
 		 608 aa  180  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1126  oxaloacetate decarboxylase  28.92 
 
 		 607 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3266  oxaloacetate decarboxylase  28.92 
 
 		 607 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0475332 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0531  pyruvate carboxylase subunit B  27.9 
 
 		 596 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0320  oxaloacetate decarboxylase  31.62 
 
 		 605 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0085  oxaloacetate decarboxylase  30.79 
 
 		 597 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0033  oxaloacetate decarboxylase  31.44 
 
 		 499 aa  178  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000614565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3084  oxaloacetate decarboxylase  31.44 
 
 		 499 aa  178  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000401568  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3336  oxaloacetate decarboxylase  29.08 
 
 		 602 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131691 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1435  Pyruvate carboxylase  33.17 
 
 		 507 aa  177  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0139  pyruvate carboxylase subunit B  29.46 
 
 		 616 aa  177  5e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0177448  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5754  pyruvate carboxylase  30.98 
 
 		 1169 aa  177  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1556  pyruvate carboxylase subunit B  31.41 
 
 		 604 aa  176  7e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.411533  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1066  oxaloacetate decarboxylase  28.73 
 
 		 592 aa  176  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1321  oxaloacetate decarboxylase  28.63 
 
 		 604 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0140986 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002525  oxaloacetate decarboxylase alpha chain  30.34 
 
 		 594 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.450431  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03491  oxaloacetate decarboxylase  30.72 
 
 		 593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0250  pyruvate carboxylase subunit B  32.62 
 
 		 582 aa  173  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1049  oxaloacetate decarboxylase  31.88 
 
 		 592 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7328  pyruvate carboxylase  30.17 
 
 		 1172 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_128  oxaloacetate decarboxylase, alpha subunit  32.89 
 
 		 587 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2893  oxaloacetate decarboxylase  29.62 
 
 		 592 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345555  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1781  pyruvate carboxylase  28.07 
 
 		 1158 aa  172  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1119  pyruvate carboxylase  28.88 
 
 		 1169 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5521  pyruvate carboxylase  30.59 
 
 		 1173 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1716  pyruvate carboxylase  28.07 
 
 		 1158 aa  172  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0119  pyruvate carboxylase subunit B  32.62 
 
 		 584 aa  171  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.698581  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3139  pyruvate carboxylase  29.4 
 
 		 1184 aa  171  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1220  oxaloacetate decarboxylase  28.29 
 
 		 601 aa  170  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0185712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2485  pyruvate carboxylase  29.76 
 
 		 1145 aa  170  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0971  oxaloacetate decarboxylase  29.53 
 
 		 595 aa  170  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.195309  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0894  oxaloacetate decarboxylase  29.58 
 
 		 589 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1606  oxaloacetate decarboxylase alpha subunit  32.09 
 
 		 608 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0818232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3543  oxaloacetate decarboxylase  29.8 
 
 		 589 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.549121  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0862  oxaloacetate decarboxylase  29.58 
 
 		 590 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0062  oxaloacetate decarboxylase  29.58 
 
 		 588 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0060  oxaloacetate decarboxylase  29.58 
 
 		 591 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.653336 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3615  oxaloacetate decarboxylase  29.27 
 
 		 589 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0060  oxaloacetate decarboxylase  29.36 
 
 		 590 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580433  normal  0.307421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0803  oxaloacetate decarboxylase  29.58 
 
 		 589 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3508  pyruvate carboxylase subunit B  31.62 
 
 		 621 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000543633  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3712  oxaloacetate decarboxylase  29.36 
 
 		 590 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0059  oxaloacetate decarboxylase  29.4 
 
 		 591 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.265333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2603  pyruvate carboxylase subunit B  31.61 
 
 		 624 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000143186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0831  oxaloacetate decarboxylase  29.58 
 
 		 591 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2986  oxaloacetate decarboxylase  27.62 
 
 		 611 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.657693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1199  oxaloacetate decarboxylase  27.62 
 
 		 603 aa  167  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0202  oxaloacetate decarboxylase  30.2 
 
 		 599 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0677  pyruvate carboxylase  29.64 
 
 		 1154 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418471 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1230  Conserved carboxylase region  28.06 
 
 		 475 aa  166  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0075  hypothetical protein  31.56 
 
 		 681 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1435  pyruvate carboxylase subunit B  28.95 
 
 		 638 aa  165  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000897989  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3165  oxaloacetate decarboxylase  29.19 
 
 		 611 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0061  oxaloacetate decarboxylase  29.36 
 
 		 589 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4597  pyruvate carboxylase  29.51 
 
 		 1157 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4375  pyruvate carboxylase  28.92 
 
 		 1153 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3068  oxaloacetate decarboxylase  27.39 
 
 		 611 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1064  pyruvate carboxylase subunit B  29.92 
 
 		 634 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000214042  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3544  oxaloacetate decarboxylase  28.95 
 
 		 589 aa  165  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4144  pyruvate carboxylase  29.82 
 
 		 1144 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1306  oxaloacetate decarboxylase  30.75 
 
 		 596 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  0.0412594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3026  oxaloacetate decarboxylase  30.79 
 
 		 520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.444345 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0519  pyruvate carboxylase  28.27 
 
 		 1144 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1733  pyruvate carboxylase subunit B  31.63 
 
 		 567 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0273  pyruvate carboxylase  28.6 
 
 		 1148 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.322255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>