35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0602 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  256  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  44.94 
 
 		 299 aa  93.6  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  35.71 
 
 		 917 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  35.16 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  32.69 
 
 		 503 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  35.85 
 
 		 785 aa  67.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  36.46 
 
 		 768 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  37.78 
 
 		 922 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  32.65 
 
 		 465 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  30.33 
 
 		 911 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  36.36 
 
 		 646 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  32.76 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  25.76 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  30.68 
 
 		 468 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  32.99 
 
 		 724 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  29.57 
 
 		 924 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  31.2 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 		 756 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  31.82 
 
 		 841 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  29.03 
 
 		 729 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  30.59 
 
 		 922 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  27.88 
 
 		 805 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  30.68 
 
 		 1129 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5046  hypothetical protein  33 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.401847 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  29.07 
 
 		 651 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  29.81 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  28.89 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  27.13 
 
 		 1097 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  23.08 
 
 		 507 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  28.46 
 
 		 765 aa  43.5  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5681  hypothetical protein  31.87 
 
 		 223 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal  0.0818693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0348  hypothetical protein  27.69 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 		 1091 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  31.4 
 
 		 883 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  30.11 
 
 		 1066 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>