More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2875 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  73.82 
 
 		 191 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  73.3 
 
 		 191 aa  299  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  73.3 
 
 		 191 aa  299  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  73.82 
 
 		 191 aa  298  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  73.3 
 
 		 191 aa  298  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  73.82 
 
 		 191 aa  297  7e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  73.82 
 
 		 191 aa  296  9e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  70.68 
 
 		 191 aa  296  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  71.73 
 
 		 192 aa  290  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  76.44 
 
 		 191 aa  288  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  70.68 
 
 		 191 aa  288  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  73.45 
 
 		 177 aa  276  9e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3370  hypothetical protein  72.25 
 
 		 191 aa  275  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  65.45 
 
 		 190 aa  260  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  64.33 
 
 		 188 aa  237  5.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  57.59 
 
 		 189 aa  227  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  56.54 
 
 		 189 aa  226  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  56.54 
 
 		 189 aa  224  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  61.76 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  59.66 
 
 		 176 aa  218  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  56.54 
 
 		 191 aa  219  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  60.59 
 
 		 191 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  60.59 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  55.68 
 
 		 199 aa  215  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  57.49 
 
 		 196 aa  215  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  54.45 
 
 		 191 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  54.45 
 
 		 191 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  51.31 
 
 		 192 aa  214  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  54.45 
 
 		 191 aa  214  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  54.45 
 
 		 191 aa  214  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  54.45 
 
 		 191 aa  214  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  54.45 
 
 		 191 aa  214  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  54.45 
 
 		 191 aa  214  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  54.45 
 
 		 191 aa  214  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  53.93 
 
 		 191 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  51.81 
 
 		 193 aa  212  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  58.82 
 
 		 189 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  51.83 
 
 		 191 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  51.83 
 
 		 191 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  51.83 
 
 		 191 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  52.36 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  51.83 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  51.31 
 
 		 191 aa  207  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  53.16 
 
 		 192 aa  206  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  53.16 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  53.16 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  52.36 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  53.16 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  52.88 
 
 		 192 aa  205  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  52.31 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  52.94 
 
 		 192 aa  187  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  52.94 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  48.84 
 
 		 198 aa  185  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  52.66 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  50.59 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  50.59 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  50.59 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  50 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  44.71 
 
 		 201 aa  175  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  46.15 
 
 		 179 aa  157  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  41.21 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  41.82 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  42.58 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  37.65 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  39.53 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  39.44 
 
 		 182 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  43.36 
 
 		 285 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  35.38 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  37.36 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  35.9 
 
 		 197 aa  117  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  37.79 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  39.49 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  34.38 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  35.26 
 
 		 213 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  42.04 
 
 		 201 aa  114  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  35.26 
 
 		 213 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  39.49 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  42.75 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  33.94 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  35.25 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  36.08 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  38.79 
 
 		 201 aa  111  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  35.03 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  35.39 
 
 		 182 aa  110  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  37.79 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  37.24 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  37.11 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  34.43 
 
 		 183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  40.38 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  37.87 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  37.43 
 
 		 178 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  36.65 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  38.6 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  38.6 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  34.29 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  37.23 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  39.31 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  37.58 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  37.2 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>