248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1873 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1873  channel protein, hemolysin III family protein  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2021  channel protein, hemolysin III family  67.26 
 
 		 227 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523934  hitchhiker  0.00605701 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2441  hemolysin III family channel protein  67.26 
 
 		 227 aa  308  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2325  hemolysin III family channel protein  67.26 
 
 		 227 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.988522  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2325  hemolysin III family channel protein  67.11 
 
 		 227 aa  307  9e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1920  hemolysin III family channel protein  65.49 
 
 		 227 aa  305  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  68.16 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  64.84 
 
 		 226 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  62.84 
 
 		 236 aa  272  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1934  hemolysin III family channel protein  68.75 
 
 		 227 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.680237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1879  hemolysin III family channel protein  68.27 
 
 		 227 aa  268  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2099  hemolysin III family channel protein  67.31 
 
 		 227 aa  267  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0169079  normal  0.972179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  67.58 
 
 		 226 aa  267  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1768  hemolysin III family channel protein  63.04 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000462203  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2447  hemolysin III family channel protein  67.31 
 
 		 217 aa  262  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  57.08 
 
 		 241 aa  244  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  53.64 
 
 		 216 aa  208  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  52.68 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  53.37 
 
 		 215 aa  204  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  51.18 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  50.72 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  51.92 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  50 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  50 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  50 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  50 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  50 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  51.66 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  50 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  50 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  50 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  51.44 
 
 		 215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  50 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  51.66 
 
 		 219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  51.66 
 
 		 219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  51.66 
 
 		 219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  51.66 
 
 		 219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  51.66 
 
 		 219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  51.17 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  54.03 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  46.86 
 
 		 218 aa  185  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  44.88 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3838  hemolysin III family protein  49.56 
 
 		 233 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.69609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0870  hemolysin III family protein  49.56 
 
 		 233 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0873  hemolysin III family channel protein  49.56 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  45.54 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  44.55 
 
 		 218 aa  177  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  44.55 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  44.55 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  44.55 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  44.55 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  44.55 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  44.55 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  44.06 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  44.06 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  41.67 
 
 		 213 aa  175  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  45.67 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  44.55 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  46.33 
 
 		 216 aa  172  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  41.83 
 
 		 215 aa  171  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  39.72 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  43.6 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  44.16 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  40.87 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03143  putative hemolysin III  42.86 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  39.82 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1732  channel protein, hemolysin III family  41.83 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  41.35 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  40.59 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  37.68 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  38.42 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  38.14 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1550  channel protein, hemolysin III family  34.8 
 
 		 211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561476  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  39.71 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  38.61 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  38.61 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  34.08 
 
 		 257 aa  141  9e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  37.5 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  42.38 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  36.32 
 
 		 221 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  37.98 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  35.78 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  34.51 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  34.98 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  42.57 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  35.18 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  37.38 
 
 		 518 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1381  hemolysin III-like protein  36.95 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.438791  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0747  Hly-III family protein  38.92 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1608  Hly-III family protein  35.1 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  0.167379 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  37.88 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0127  hemolysin III-like protein  40.1 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000707276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  39.42 
 
 		 216 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1889  Hly-III family protein  34.62 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.582334 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3388  Hly-III related proteins  36.02 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0217913  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  35.09 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  34.85 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  33.49 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  35.32 
 
 		 205 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  36.27 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>