More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3236 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3236  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
225 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.595033  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3416  ABC transporter ATP-binding protein  99.11 
 
 
225 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.120331 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3247  ABC transporter ATP-binding protein  99.11 
 
 
225 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.537744  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3314  ABC transporter ATP-binding protein  99.11 
 
 
225 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3311  ABC transporter ATP-binding protein  99.49 
 
 
195 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3356  ABC transporter, ATP-binding protein  77.33 
 
 
225 aa  359  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4228  ABC transporter, ATP-binding protein  77.33 
 
 
225 aa  359  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3261  ABC transporter, ATP-binding protein  76.89 
 
 
225 aa  357  6e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.770994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3068  ABC transporter, ATP-binding protein  76 
 
 
227 aa  353  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769367  normal  0.0295076 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1256  ABC transporter related  35.94 
 
 
288 aa  131  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000452094  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  36.32 
 
 
568 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  36.95 
 
 
582 aa  118  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  33.5 
 
 
574 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  36.27 
 
 
571 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  38.66 
 
 
553 aa  115  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0006  ABC transporter related  37.91 
 
 
273 aa  111  9e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.257411  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.16 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0714  ABC transporter related  33.94 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  33.03 
 
 
605 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12820  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.78 
 
 
279 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  34 
 
 
530 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  35.5 
 
 
514 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.85 
 
 
627 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0335  ABC transporter related  31.94 
 
 
228 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0378349 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2736  ABC transporter related protein  40.62 
 
 
234 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.27 
 
 
276 aa  104  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  35.19 
 
 
574 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0499  ABC transporter related  41.32 
 
 
271 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.594452 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.64 
 
 
277 aa  102  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0288  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.23 
 
 
277 aa  102  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337056  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.06 
 
 
495 aa  101  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  35.47 
 
 
278 aa  101  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  38.5 
 
 
530 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.48 
 
 
274 aa  101  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.16 
 
 
277 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.57 
 
 
550 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  30.91 
 
 
510 aa  100  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.76 
 
 
280 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.76 
 
 
280 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  37.81 
 
 
276 aa  99.4  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  32.02 
 
 
272 aa  99.4  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  33.33 
 
 
593 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  33.52 
 
 
512 aa  99  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
630 aa  99  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.2 
 
 
280 aa  99  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  34.03 
 
 
518 aa  98.6  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  34.52 
 
 
299 aa  98.6  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  33.85 
 
 
568 aa  98.2  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.63 
 
 
562 aa  98.2  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.22 
 
 
280 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.16 
 
 
279 aa  97.4  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.22 
 
 
300 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.22 
 
 
300 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.22 
 
 
300 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.22 
 
 
280 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.22 
 
 
280 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  34.23 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.68 
 
 
310 aa  97.1  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2302  putative ABC transporter  35.2 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0179898  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  31.41 
 
 
641 aa  97.1  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  36.98 
 
 
277 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.07 
 
 
280 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.42 
 
 
284 aa  96.7  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.97 
 
 
276 aa  96.7  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  33.79 
 
 
526 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0830  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.31 
 
 
280 aa  95.5  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1962  ABC transporter, ATPase subunit  31.08 
 
 
269 aa  95.5  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  33.33 
 
 
497 aa  95.5  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.94 
 
 
280 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  30.77 
 
 
571 aa  95.5  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.33 
 
 
277 aa  95.1  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  33.51 
 
 
250 aa  94.7  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1924  ABC transporter related  37.36 
 
 
353 aa  94.7  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405709 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.07 
 
 
280 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  37.5 
 
 
281 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  32.02 
 
 
581 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  28.38 
 
 
568 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
770 aa  92.8  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2472  ABC transporter related  40.59 
 
 
284 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324345  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  33.68 
 
 
548 aa  92.8  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  37.31 
 
 
271 aa  92.4  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.29 
 
 
254 aa  92.4  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0507  ABC transporter related  36.98 
 
 
234 aa  92.4  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  34.84 
 
 
531 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1131  ABC transporter related  43.06 
 
 
570 aa  92  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.844878  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  34.92 
 
 
516 aa  92  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.34 
 
 
279 aa  92  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2301  putative ABC transporter  35.71 
 
 
289 aa  92  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00300112  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  35.5 
 
 
564 aa  91.7  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.13 
 
 
250 aa  91.7  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0475  cobalt transport protein ATP-binding subunit  34.52 
 
 
280 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  31.44 
 
 
470 aa  90.9  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.09 
 
 
281 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  36.53 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  33.33 
 
 
535 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0318  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.55 
 
 
285 aa  90.5  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.84205e-21 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0887  ABC transporter related protein  40 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.754579  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  35.62 
 
 
534 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>