162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2305 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 279 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  83.51 
 
 		 279 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2185  2OG-Fe(II) oxygenase  83.51 
 
 		 279 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  83.51 
 
 		 279 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2394  2OG-Fe(II) oxygenase  83.51 
 
 		 279 aa  484  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  83.15 
 
 		 279 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  83.15 
 
 		 279 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  83.15 
 
 		 279 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  82.8 
 
 		 279 aa  482  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  83.15 
 
 		 279 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  81.72 
 
 		 279 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  81 
 
 		 279 aa  475  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  77.42 
 
 		 279 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  79.93 
 
 		 279 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  78.14 
 
 		 279 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  76.34 
 
 		 290 aa  454  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  74.55 
 
 		 279 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  74.19 
 
 		 279 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  70.97 
 
 		 279 aa  430  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  68.82 
 
 		 279 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  66.55 
 
 		 280 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  64.75 
 
 		 279 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0015  2OG-Fe(II) oxygenase  56.55 
 
 		 287 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00371983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  45.85 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  35.93 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  35.48 
 
 		 317 aa  152  8.999999999999999e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  35.35 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  33.55 
 
 		 348 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  31.65 
 
 		 312 aa  138  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  34.5 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  34.08 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  32.24 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  33 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  31.95 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  32.77 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  32.29 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  32.42 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  30.39 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  28.52 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  28.41 
 
 		 330 aa  99.4  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  29.3 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  28.36 
 
 		 321 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  26.09 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  28.31 
 
 		 321 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  30.15 
 
 		 337 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  26.28 
 
 		 321 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  27.21 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  27.37 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  26.02 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  28.41 
 
 		 337 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  26.74 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  32.26 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  25.37 
 
 		 316 aa  85.9  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  29.92 
 
 		 334 aa  85.5  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  29.28 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  40.77 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  25.93 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  29.23 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  27.78 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  28.19 
 
 		 323 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  26.25 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  27.47 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  28.08 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  30.8 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  30.8 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  27.78 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  30.8 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  26.86 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  31.68 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  26.52 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  25.89 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  27.64 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00880  conserved hypothetical protein  27.11 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  27.41 
 
 		 323 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  25.89 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05542  conserved hypothetical protein  26.01 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0412788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  25.21 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  27.2 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51972  flavonol synthase  35.07 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.842126 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  31.86 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  27.59 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1992  2OG-Fe(II) oxygenase  34.19 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  28.16 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  28.16 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  28.16 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  29.5 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  36.88 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  25.53 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1085  2OG-Fe(II) oxygenase  36.17 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.758067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  27.34 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  25.78 
 
 		 340 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  27.76 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  27.76 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  27.76 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  31.62 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  31.62 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  24.5 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  24.62 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  29.8 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>