42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2105 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 191 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  50.71 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  49.65 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  42.62 
 
 		 164 aa  101  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  41.22 
 
 		 179 aa  98.6  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  36.99 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.84 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  40.85 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  39.02 
 
 		 167 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  34.06 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  29.11 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0110  hypothetical protein  27.37 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00209579  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1875  phosphoglycerate mutase family protein  37.68 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1359  hypothetical protein  26.92 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0327501  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3824  hypothetical protein  26.67 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 440 aa  44.7  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  42.62 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  41.1 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 209 aa  42  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  31.03 
 
 		 154 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  42.62 
 
 		 192 aa  42  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 		 374 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  36.99 
 
 		 245 aa  41.2  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  31.03 
 
 		 154 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  39.34 
 
 		 198 aa  41.2  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0238  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 402 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>