More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2154 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  100 
 
 		 396 aa  821    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1770  NifS family cysteine desulfurase  71.21 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.406981  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1696  cysteine desulfurase  71.72 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  71.21 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1486  cysteine desulfurase/aminotransferase, IscS/NifS family  70 
 
 		 392 aa  568  1e-161  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  68.91 
 
 		 404 aa  567  1e-160  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0042  NifS family cysteine desulfurase  66.67 
 
 		 396 aa  564  1e-160  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0238  putative cysteine desulfurase  67.87 
 
 		 393 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0291  cysteine desulfurase  67.87 
 
 		 393 aa  559  1e-158  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0265  cysteine desulfurase, putative  67.61 
 
 		 393 aa  559  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.87 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  47.44 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  47.77 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  49.35 
 
 		 398 aa  364  2e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  49.34 
 
 		 400 aa  364  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  48.21 
 
 		 400 aa  364  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  46.72 
 
 		 391 aa  363  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  48.29 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  48.35 
 
 		 401 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  47.51 
 
 		 389 aa  358  8e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  47.77 
 
 		 389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  47.77 
 
 		 389 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  47.53 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  48.03 
 
 		 402 aa  353  4e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  46.45 
 
 		 402 aa  352  7e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.15 
 
 		 404 aa  352  7e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  46.74 
 
 		 391 aa  351  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  46.45 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  46.45 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  46.41 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  45.64 
 
 		 402 aa  351  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  46.75 
 
 		 394 aa  349  4e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  46.98 
 
 		 384 aa  348  7e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  46.74 
 
 		 384 aa  348  7e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  45.43 
 
 		 391 aa  348  9e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.69 
 
 		 398 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  45.67 
 
 		 388 aa  346  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  47.24 
 
 		 394 aa  346  4e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  46.23 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  46.23 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  46.34 
 
 		 400 aa  345  6e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  45.97 
 
 		 392 aa  345  8.999999999999999e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  47.64 
 
 		 407 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  45.9 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  49.35 
 
 		 386 aa  343  4e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  45.76 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  46.19 
 
 		 384 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  48.19 
 
 		 382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  46.48 
 
 		 405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  46.23 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  46.25 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  46.19 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  44.5 
 
 		 414 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  45.43 
 
 		 382 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  45.84 
 
 		 403 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  46.56 
 
 		 417 aa  334  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  45.48 
 
 		 398 aa  332  9e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  44.82 
 
 		 398 aa  330  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  44.68 
 
 		 396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  43.68 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  44.24 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  43.4 
 
 		 507 aa  326  4.0000000000000003e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  44.42 
 
 		 394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  44.67 
 
 		 393 aa  325  6e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  43.12 
 
 		 379 aa  325  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  43.15 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  45.85 
 
 		 396 aa  324  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  43.99 
 
 		 407 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  43.99 
 
 		 407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  43.73 
 
 		 407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  43.73 
 
 		 407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  43.99 
 
 		 407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  43.73 
 
 		 407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  44.91 
 
 		 388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  43.99 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  43.32 
 
 		 405 aa  318  7e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  44.7 
 
 		 405 aa  318  9e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  45.24 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 405 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  43.18 
 
 		 405 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  43.18 
 
 		 405 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  43.78 
 
 		 389 aa  317  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  42.82 
 
 		 392 aa  316  4e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  45.29 
 
 		 397 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  42.82 
 
 		 400 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  44.65 
 
 		 388 aa  315  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  42.97 
 
 		 407 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  43.07 
 
 		 403 aa  316  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  43.01 
 
 		 407 aa  315  9e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  42.68 
 
 		 407 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  45.2 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  44.5 
 
 		 383 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  43.18 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  44.39 
 
 		 387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>