58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1250 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  100 
 
 
541 aa  1098    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  90.25 
 
 
4798 aa  720    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  88.66 
 
 
844 aa  785    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  88.35 
 
 
679 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  85.62 
 
 
585 aa  259  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  79.08 
 
 
582 aa  239  8e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  45.93 
 
 
959 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  37.45 
 
 
1112 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  35.76 
 
 
940 aa  157  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  35.03 
 
 
1789 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.11 
 
 
1925 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  36.5 
 
 
1814 aa  145  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.09 
 
 
2107 aa  140  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  36.74 
 
 
3598 aa  139  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  46.51 
 
 
618 aa  137  4e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  40.64 
 
 
1499 aa  135  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  33.11 
 
 
1306 aa  131  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  42.11 
 
 
1809 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  34.21 
 
 
1607 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  37.74 
 
 
1480 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  37.09 
 
 
999 aa  124  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  37.38 
 
 
928 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  36.54 
 
 
428 aa  113  9e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  36.41 
 
 
960 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  44.2 
 
 
466 aa  106  9e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  36.36 
 
 
1805 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  34.44 
 
 
4687 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  43.08 
 
 
548 aa  99.4  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  38.28 
 
 
337 aa  90.5  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  42.48 
 
 
320 aa  88.6  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  42.73 
 
 
677 aa  87  9e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0571  hypothetical protein  38.92 
 
 
2682 aa  86.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  32.97 
 
 
326 aa  86.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  42.34 
 
 
532 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3833  hypothetical protein  39.57 
 
 
364 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  30.72 
 
 
2767 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  44.9 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  32.39 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  35.61 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  30.91 
 
 
2296 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0885  hypothetical protein  31.46 
 
 
788 aa  72.8  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854858  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  30.23 
 
 
3209 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  32.35 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0371  hypothetical protein  35.25 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6671  hypothetical protein  30.49 
 
 
755 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538949  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0822  membrane protein  29.19 
 
 
310 aa  67  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  30.86 
 
 
1544 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1995  hypothetical protein  33.65 
 
 
371 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0768  hypothetical protein  35.04 
 
 
346 aa  64.7  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000331369  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  32.37 
 
 
422 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0514  hypothetical protein  29.45 
 
 
351 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241085  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  27.36 
 
 
2113 aa  62  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0082  hypothetical protein  32.93 
 
 
295 aa  61.2  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.590083  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0034  hypothetical protein  27.56 
 
 
327 aa  60.5  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1901  hypothetical protein  33.96 
 
 
435 aa  59.7  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  33.55 
 
 
2911 aa  59.7  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2875  hypothetical protein  27.41 
 
 
435 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2201  hypothetical protein  42.11 
 
 
265 aa  47.4  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.139825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>