More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1222 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1222  ABC transporter related protein  100 
 
 
297 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0276303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0445  ATPase  54.03 
 
 
295 aa  342  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0849  ABC transporter related  50.34 
 
 
301 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0333134 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1574  ABC transporter related  50 
 
 
301 aa  311  7.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000043454  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2218  methyltransferase  43.19 
 
 
280 aa  231  1e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.301934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  31.06 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.84 
 
 
312 aa  130  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2233  ABC transporter related  29.04 
 
 
307 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2604  ABC transporter, ATP-binding protein  29.04 
 
 
307 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  29.9 
 
 
290 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  27.82 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  30.41 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  29.67 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  29.05 
 
 
282 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 
290 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 
290 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  28.92 
 
 
290 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  31.22 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  27.02 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  28.43 
 
 
290 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  28.57 
 
 
290 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  29.02 
 
 
287 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  29.02 
 
 
287 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  28.47 
 
 
324 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  30.7 
 
 
300 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  27.39 
 
 
291 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0409  ABC transporter related  31.53 
 
 
280 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00250472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0399  ABC transporter related  31.53 
 
 
280 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00135528  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  30.2 
 
 
287 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  31.19 
 
 
280 aa  122  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  28.02 
 
 
300 aa  122  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  29.02 
 
 
287 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  30.2 
 
 
287 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  28.82 
 
 
284 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  30.2 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  28.37 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  30.17 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  29.96 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  28.62 
 
 
305 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  29.71 
 
 
300 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  31.96 
 
 
276 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  29.28 
 
 
240 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  29.05 
 
 
318 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  31.79 
 
 
287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  32.83 
 
 
287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  29.69 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  25.96 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  29.69 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  30.13 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  31.98 
 
 
312 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3247  ABC transporter related  28.7 
 
 
299 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  32.42 
 
 
293 aa  119  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  28.67 
 
 
310 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  32.14 
 
 
287 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  34.16 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7291  ABC transporter related  29.66 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  29.54 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  28.09 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1336  ABC transporter related protein  30.99 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  32.37 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  29.07 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  31.65 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  30.7 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  28.67 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  33.67 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  32.55 
 
 
282 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.42 
 
 
286 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  30.96 
 
 
291 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  32.32 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  31.95 
 
 
310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.71 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  32.7 
 
 
337 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  33.15 
 
 
280 aa  115  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  30.7 
 
 
290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  34.29 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  32.24 
 
 
285 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  29.55 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  29.26 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  29.3 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  26.82 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  29.07 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0372  ABC transporter related  31.71 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  31.28 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  29.45 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  27.83 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2970  ABC transporter related protein  28.43 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.020184  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  26.86 
 
 
301 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  30.1 
 
 
331 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  29.95 
 
 
274 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  31.75 
 
 
346 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  30.32 
 
 
304 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  31.28 
 
 
337 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  32.29 
 
 
289 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  28.88 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>