More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0154 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0154  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  100 
 
 
289 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.383196  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  69.69 
 
 
289 aa  402  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1159  prenyltransferase  68.44 
 
 
286 aa  385  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.848518  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  62.63 
 
 
286 aa  358  8e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  62.06 
 
 
291 aa  353  2e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  60.28 
 
 
289 aa  346  3e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  60.71 
 
 
294 aa  336  2.9999999999999997e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0324  prenyltransferase  60.63 
 
 
290 aa  333  1e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0200  prenyltransferase  60.36 
 
 
294 aa  332  5e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  60 
 
 
294 aa  330  1e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  40.43 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1337  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.59 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3374  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.58 
 
 
287 aa  195  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2015  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  42.86 
 
 
287 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  38.3 
 
 
298 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0232  prenyltransferase  37.77 
 
 
289 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1490  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.28 
 
 
285 aa  186  5e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512063  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0216  prenyltransferase  37.77 
 
 
289 aa  185  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0651  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.28 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00254514  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1392  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.72 
 
 
285 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0397  prenyltransferase  38.16 
 
 
288 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0975  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.36 
 
 
288 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1038  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.06 
 
 
283 aa  175  7e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0379188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0290  prenyltransferase  38.89 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3612  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  36.88 
 
 
287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1451  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.84 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0139046  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.63 
 
 
288 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000163597  hitchhiker  0.000177329 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0096  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.27 
 
 
285 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0256  prenyltransferase  36.3 
 
 
314 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.991703  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3757  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.39 
 
 
298 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.987764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4282  prenyltransferase  36.61 
 
 
290 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0678  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  33.92 
 
 
282 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0184181  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  34.28 
 
 
288 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3210  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  34.52 
 
 
290 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0129824  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1902  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.93 
 
 
288 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2196  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  34.97 
 
 
284 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0516  prenyltransferase  32.06 
 
 
319 aa  152  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2205  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.82 
 
 
294 aa  152  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1088  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  34.27 
 
 
284 aa  151  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0563652  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14810  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.64 
 
 
287 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0823  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.68 
 
 
311 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167929  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2388  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.69 
 
 
283 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306171  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0288  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  37.46 
 
 
294 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0176  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.9 
 
 
286 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0715636  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4093  prenyltransferase  32.74 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8072  prenyltransferase  33.81 
 
 
315 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6114  prenyltransferase  32.97 
 
 
315 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4513  prenyltransferase  33.7 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4209  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  41.43 
 
 
301 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102097  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0316  prenyltransferase  31.94 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.65204e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0369  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  35.5 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.1864  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2322  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  33.8 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0397  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  43.66 
 
 
286 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0398  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.37 
 
 
286 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.967191  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0609  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  30.63 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000295673 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0581  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.34 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00583623  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1512  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  33.33 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.378404  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0582  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.03 
 
 
295 aa  87  4e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00112694  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.5 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0441  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.57 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.351552  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.41 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.41 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1574  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  33.82 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000853939 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0619  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.42 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0645  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.06 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0492  prenyltransferase  26.71 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.203515  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0965  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.75 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5382  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.12 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0477  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.94 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.036458  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.8 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0697  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.1 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370156  normal  0.206083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3815  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.67 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.38 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.78 
 
 
302 aa  79  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.29 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2246  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.33 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0326669  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0245  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.69 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0729  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.69 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262552  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.3 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.34 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  32.18 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1486  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.78 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1018  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  26.97 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2330  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  26.72 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4711  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.57 
 
 
310 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1159  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.67 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0363  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  33.73 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2519  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.5 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  0.917266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0824  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.02 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0053  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.64 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0716312  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3595  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.31 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02871  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.07 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2562  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.57 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5064  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.24 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0715  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28 
 
 
287 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.959768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2921  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.2 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472236  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2657  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.24 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2803  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.87 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0044  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.69 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3112  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.32 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>