More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5064 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_5064  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  100 
 
 
286 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0596  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  78.37 
 
 
295 aa  434  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0474  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  79.51 
 
 
286 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2330  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  75.53 
 
 
295 aa  414  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1613  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  73.94 
 
 
288 aa  400  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0142555 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0326  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  78.49 
 
 
289 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0277634 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3680  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  72.63 
 
 
296 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0380  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  65.6 
 
 
290 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0371  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  65.6 
 
 
290 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.156009  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3743  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  71.08 
 
 
307 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.33566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1016  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  64.18 
 
 
297 aa  343  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0619  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  59.72 
 
 
290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0645  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  59.36 
 
 
290 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3815  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  59.01 
 
 
287 aa  323  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0697  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  59.01 
 
 
287 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370156  normal  0.206083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0245  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  59.01 
 
 
287 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0729  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  59.01 
 
 
287 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1286  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  58.6 
 
 
310 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2657  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  59.01 
 
 
287 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3350  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  58.6 
 
 
287 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3316  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  58.6 
 
 
287 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2582  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  58.25 
 
 
287 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  58.25 
 
 
316 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.38401  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1173  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  58.25 
 
 
370 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3361  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  58.25 
 
 
316 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230126  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2519  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  57.09 
 
 
287 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  0.917266 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0312  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  58.25 
 
 
370 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2611  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  57.69 
 
 
290 aa  298  9e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0715  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  57.5 
 
 
287 aa  295  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.959768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3983  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  57.5 
 
 
287 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0413  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.74 
 
 
296 aa  290  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0054  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.74 
 
 
296 aa  288  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0138918  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2509  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  56.38 
 
 
291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2803  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  56.49 
 
 
285 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2921  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  56.99 
 
 
280 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472236  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0824  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  57.55 
 
 
292 aa  271  7e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5031  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.76 
 
 
296 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2939  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  58.66 
 
 
294 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105208  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1786  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  52.63 
 
 
287 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5476  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  53.05 
 
 
296 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0463  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  55.09 
 
 
293 aa  268  8e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1503  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  52.63 
 
 
287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2686  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  57.09 
 
 
291 aa  262  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02871  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.9 
 
 
299 aa  256  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3252  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.99 
 
 
298 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4399  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  46.38 
 
 
284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  47.57 
 
 
286 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  46.64 
 
 
284 aa  253  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0044  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.38 
 
 
299 aa  252  6e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.39 
 
 
284 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.26 
 
 
286 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0053  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.01 
 
 
299 aa  249  3e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0716312  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2048  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  45.74 
 
 
287 aa  249  4e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.18 
 
 
286 aa  248  9e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0140  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  46.04 
 
 
287 aa  248  9e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.654949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5318  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.28 
 
 
296 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.26 
 
 
285 aa  247  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5226  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.28 
 
 
296 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0156  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.56 
 
 
296 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0965  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.64 
 
 
299 aa  246  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271339  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4280  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.84 
 
 
290 aa  245  8e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5365  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.28 
 
 
296 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.346697 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03912  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.84 
 
 
290 aa  244  9e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3953  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  51.84 
 
 
290 aa  244  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5521  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.84 
 
 
290 aa  244  9e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272125  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.84 
 
 
290 aa  244  9e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3988  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.84 
 
 
290 aa  244  9e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4502  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.84 
 
 
290 aa  244  9e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4593  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.84 
 
 
290 aa  244  9e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.568331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03872  hypothetical protein  51.84 
 
 
290 aa  244  9e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4409  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.72 
 
 
296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0458215 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3527  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.44 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5604  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.03 
 
 
296 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48510  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.38 
 
 
295 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.826372  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.83 
 
 
288 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3808  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.71 
 
 
311 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.466325  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.92 
 
 
296 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3595  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  47.65 
 
 
294 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6135  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.28 
 
 
296 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3401  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50 
 
 
287 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3837  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  47.43 
 
 
299 aa  239  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0373903  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00072  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.32 
 
 
286 aa  238  8e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2283  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  49.64 
 
 
289 aa  238  9e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642168 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.9 
 
 
286 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1217  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.41 
 
 
285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.45215  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0420  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.21 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.36 
 
 
287 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0128  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  48.24 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2438  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.67 
 
 
293 aa  232  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0511  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.64 
 
 
287 aa  231  9e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0442  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.83 
 
 
286 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.13 
 
 
286 aa  229  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3891  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.49 
 
 
286 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3817  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.49 
 
 
286 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4014  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.49 
 
 
286 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3863  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.73 
 
 
288 aa  228  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.508575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0679  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.73 
 
 
288 aa  228  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0483  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.35 
 
 
302 aa  228  6e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3773  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.73 
 
 
288 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0244  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.57 
 
 
289 aa  227  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>