175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0385 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  60.54 
 
 		 624 aa  698    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  100 
 
 		 631 aa  1287    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  58.23 
 
 		 612 aa  679    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  40 
 
 		 626 aa  385  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  31.63 
 
 		 883 aa  243  9e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  30.46 
 
 		 884 aa  230  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  35.08 
 
 		 887 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  32.69 
 
 		 625 aa  172  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  31.3 
 
 		 583 aa  171  4e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  33.05 
 
 		 630 aa  166  9e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  28.11 
 
 		 607 aa  146  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1083  hypothetical protein  27.96 
 
 		 623 aa  143  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.638894  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2071  phosphatase-like protein  30.36 
 
 		 688 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  30.23 
 
 		 654 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  30 
 
 		 678 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  30.3 
 
 		 652 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  30 
 
 		 678 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  29.61 
 
 		 651 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  28.67 
 
 		 630 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2020  twin-arginine translocation pathway signal  30.28 
 
 		 648 aa  138  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  28.93 
 
 		 653 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5110  putative exported alkaline phosphatase  29.89 
 
 		 673 aa  135  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  29.06 
 
 		 654 aa  135  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  29.61 
 
 		 653 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  28.42 
 
 		 650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  28.07 
 
 		 650 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  28.93 
 
 		 653 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  28.93 
 
 		 653 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  28.93 
 
 		 653 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2297  phosphatase-like protein  28.11 
 
 		 631 aa  127  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937411  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  28.64 
 
 		 653 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2465  phosphatase-like protein  29.74 
 
 		 678 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  28.86 
 
 		 653 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  28.64 
 
 		 653 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  28.64 
 
 		 653 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5329  putative exported alkaline phosphatase  28.93 
 
 		 650 aa  121  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1926  putative exported alkaline phosphatase  28.12 
 
 		 651 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3826  hypothetical protein  27.83 
 
 		 662 aa  114  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.984563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  33.81 
 
 		 696 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  30.59 
 
 		 593 aa  81.3  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  30.45 
 
 		 593 aa  81.3  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  30.18 
 
 		 593 aa  80.5  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  35.16 
 
 		 629 aa  78.2  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  38.29 
 
 		 691 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  30.5 
 
 		 560 aa  73.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  33.7 
 
 		 633 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  31.79 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  33.69 
 
 		 638 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  32.28 
 
 		 596 aa  72  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  37.5 
 
 		 689 aa  71.6  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  54.24 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2572  hypothetical protein  35.67 
 
 		 697 aa  70.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.682256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  33.16 
 
 		 639 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  36.57 
 
 		 690 aa  69.7  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  28.09 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  35.55 
 
 		 677 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00705  hypothetical protein  27.3 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  34.57 
 
 		 663 aa  69.7  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1994  hypothetical protein  33.51 
 
 		 647 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  25.24 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  31.9 
 
 		 695 aa  68.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1898  hypothetical protein  37.43 
 
 		 625 aa  68.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.392483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  27.27 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  32.2 
 
 		 704 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0560  protein of unknown function DUF839  31.35 
 
 		 634 aa  67.8  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1716  hypothetical protein  30.56 
 
 		 647 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  34.46 
 
 		 651 aa  67.8  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  35.87 
 
 		 699 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  32.6 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  35.87 
 
 		 699 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  35.87 
 
 		 699 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  34.05 
 
 		 624 aa  67.4  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  32.2 
 
 		 587 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  29.32 
 
 		 389 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4059  hypothetical protein  30.43 
 
 		 651 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  34.29 
 
 		 693 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  30.54 
 
 		 718 aa  66.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  31.22 
 
 		 698 aa  66.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0239  protein of unknown function DUF839  29.32 
 
 		 695 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428928  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  34.91 
 
 		 690 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  32.63 
 
 		 681 aa  65.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2377  hypothetical protein  35.83 
 
 		 674 aa  65.1  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.331127  normal  0.538289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  31.43 
 
 		 708 aa  65.1  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  33.33 
 
 		 659 aa  64.7  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  33.33 
 
 		 659 aa  64.3  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  32.66 
 
 		 715 aa  64.3  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0331  hypothetical protein  32.14 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3373  protein of unknown function DUF839  31.61 
 
 		 702 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14033  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  29.56 
 
 		 755 aa  62.4  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  32.12 
 
 		 694 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  33.08 
 
 		 383 aa  63.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  30.83 
 
 		 377 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2835  protein of unknown function DUF839  32.64 
 
 		 689 aa  62.4  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.765189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  31.52 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2065  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 726 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105233  normal  0.260723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  35 
 
 		 628 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  32.37 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  32.54 
 
 		 694 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0609  twin-arginine translocation pathway signal  32.14 
 
 		 686 aa  61.2  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500063  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  31.77 
 
 		 738 aa  61.6  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>