96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0342 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  275  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  61.03 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  50.74 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  50.74 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  50.74 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  50.74 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  51.49 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  51.45 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  47.83 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  54.62 
 
 		 136 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  53.78 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  53.78 
 
 		 136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  52.94 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  45.8 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  49.17 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  43.75 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  41.73 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  41.73 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  37.29 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  39.42 
 
 		 131 aa  97.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  39.13 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  31.91 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  28.36 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  37.07 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  36.09 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  39.32 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  32.76 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  31.58 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  26.56 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  31.07 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  29.91 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  28.12 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  29.55 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  27.27 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  35.64 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  32.67 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  31.97 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  36.36 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  29.58 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  35.65 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  21.01 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  29.37 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  29.27 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  34.71 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  32.77 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  27.72 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  35.59 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  25.19 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0610  hypothetical protein  31.03 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  35.04 
 
 		 381 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  30.51 
 
 		 283 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  26.77 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  30.33 
 
 		 272 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 273 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  25.6 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0613  hypothetical protein  29.89 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.764284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0615  hypothetical protein  29.89 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  27.27 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  32.5 
 
 		 284 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  25.6 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  29.27 
 
 		 272 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  28.7 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  31.36 
 
 		 303 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  29.03 
 
 		 290 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.46 
 
 		 269 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  28.91 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  29.27 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0570  hypothetical protein  26.72 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  29.51 
 
 		 273 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.01 
 
 		 291 aa  44.3  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  30.7 
 
 		 269 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  30.43 
 
 		 276 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1335  hypothetical protein  25.98 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0885608  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  30 
 
 		 272 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.17 
 
 		 272 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0807  hypothetical protein  25.56 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  24.03 
 
 		 286 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  31.09 
 
 		 279 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.43 
 
 		 276 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  24.8 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.87 
 
 		 299 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  30.89 
 
 		 276 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  27.13 
 
 		 273 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  28.23 
 
 		 273 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  31.3 
 
 		 218 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  26.83 
 
 		 271 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  30.89 
 
 		 303 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  28.06 
 
 		 278 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  30.33 
 
 		 286 aa  40.8  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  28.57 
 
 		 264 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0950  hypothetical protein  39.62 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000580743  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.89 
 
 		 285 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  27.87 
 
 		 271 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>