45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01494 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  287  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  44.68 
 
 		 139 aa  120  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  45.45 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  48.31 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  41.67 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  27.07 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  27.21 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  31.73 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  26.83 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  29.06 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.76 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  29.06 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  29.06 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  29.06 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  29.21 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  28.06 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  28.06 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  28.06 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  28.06 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  26.97 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  25.42 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  31.11 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  30.43 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  28 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  28.41 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  27.42 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  20.49 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  23.97 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  30.34 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  25.62 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  23.88 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  24.17 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  27.27 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  26.96 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  29.73 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.72 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  23.3 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  23.29 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  29.41 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  28.77 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  21.6 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.36 
 
 		 139 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  20.59 
 
 		 153 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  26.13 
 
 		 134 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  26.05 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>