61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0606 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  274  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  64.71 
 
 
136 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  67.23 
 
 
136 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  66.39 
 
 
136 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  66.39 
 
 
136 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  55.88 
 
 
135 aa  165  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  49.26 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  49.26 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  49.26 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  49.26 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  50 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  52 
 
 
137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  45.6 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  47.06 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  47.37 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  43.1 
 
 
137 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  41.79 
 
 
139 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  40.6 
 
 
147 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  37.31 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  37.5 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  32.14 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  33.9 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  32.33 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  34.13 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  34.71 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  34.92 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  27.07 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  36.52 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  32 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  30.61 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  34.21 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  30.7 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  30.65 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  32.17 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  27.13 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  32.76 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  31.37 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  24.14 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  29.21 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  29.2 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  27.83 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  30.39 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  28.06 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  32.93 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  29.82 
 
 
160 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  31.68 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  24.82 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  28.57 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  27.66 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1335  hypothetical protein  31.06 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0885608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  26.4 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  26.32 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  28.99 
 
 
158 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0610  hypothetical protein  27.59 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0615  hypothetical protein  25.66 
 
 
137 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0613  hypothetical protein  26.14 
 
 
137 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.764284  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>