45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4109 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  291  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  65.94 
 
 		 139 aa  205  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  58.91 
 
 		 138 aa  174  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  55.8 
 
 		 139 aa  158  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  45.45 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  30.66 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.2 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  28.69 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  26.61 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  26.47 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  28.04 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  26.47 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  27.54 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  27.83 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  26.96 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  24.24 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  25.19 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  26.72 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  26.62 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  26.13 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  26.95 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  27.78 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  24.32 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  22.92 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  24.77 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  28.69 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  25.93 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  25 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  22.58 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  30.12 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  23.81 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  23.4 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  22.73 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  23.85 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  22.13 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  27.48 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  27.12 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  24.8 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.23 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  24.59 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  21.67 
 
 		 149 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>