52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0483 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  290  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  49.11 
 
 		 141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  42.06 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  42.34 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  37.41 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  35.04 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  35.56 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  34.19 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  37.61 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  37.61 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  37.61 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  37.61 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  36.52 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  35.25 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  28.36 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  31.93 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  31.3 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  30.15 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.65 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  27.21 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  30.51 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  30.25 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  34.35 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  27.91 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  29.66 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  28.79 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  26.43 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  28 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  28.03 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  33.05 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  28.36 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  30.33 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  27.21 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  25.58 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  31.3 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  30.43 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  22.5 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  27.27 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  28.69 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  28.07 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  30.84 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  28.71 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  27.03 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  24.78 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  29.06 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1335  hypothetical protein  27.54 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0885608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  25.55 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  32.47 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  25.9 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  21.43 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  26.05 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  27.35 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>