74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1643 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  276  9e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  66.18 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  66.18 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  66.18 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  66.18 
 
 		 145 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  55.04 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  47.83 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  52.27 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  52.52 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  55 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  55.46 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  52.94 
 
 		 136 aa  134  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  55.46 
 
 		 136 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  54.62 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  47.24 
 
 		 141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  47.83 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  40.91 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  46.15 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  40.74 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  44.53 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  41.8 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  42.62 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  39.1 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  35.25 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  31.11 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  37.07 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  28.99 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  27.54 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  34.21 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  33.06 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  32.76 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  30.08 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  37.89 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  30.71 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  34.17 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  27.2 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  27.91 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  32.56 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  31.97 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  30.28 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  35.04 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  36.14 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  34.86 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  32.23 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  31.3 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  28.41 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  25 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  36.59 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1335  hypothetical protein  28.8 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0885608  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  29.17 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  26.4 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  26.95 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  24.59 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  29.41 
 
 		 283 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  25.35 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  28.68 
 
 		 299 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  30.25 
 
 		 279 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  26.67 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  29.91 
 
 		 286 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  33.33 
 
 		 330 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 273 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  32.17 
 
 		 381 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  29.71 
 
 		 273 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  29.75 
 
 		 284 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  29.27 
 
 		 272 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0610  hypothetical protein  28.74 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  30.89 
 
 		 272 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  24.39 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  29.51 
 
 		 278 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  28 
 
 		 270 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  28.46 
 
 		 290 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  47.5 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0570  hypothetical protein  27.42 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  26.51 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>