37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02210 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  68.71 
 
 
158 aa  217  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  46.26 
 
 
160 aa  147  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  43.88 
 
 
166 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  31.34 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  31.34 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  31.34 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  31.34 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  36.14 
 
 
137 aa  61.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  29.79 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  26.92 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  34 
 
 
140 aa  58.9  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  28.97 
 
 
148 aa  58.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  32.94 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  30.84 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  27.08 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  25.38 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  21.95 
 
 
136 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  32.97 
 
 
135 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  28.33 
 
 
143 aa  51.2  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  28.87 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.07 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  26.17 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  29.76 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.97 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  27 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  27.03 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  28.89 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  28.45 
 
 
136 aa  48.1  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  28.91 
 
 
138 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  24.43 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  24.09 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  24.83 
 
 
145 aa  44.3  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  25.83 
 
 
136 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  25 
 
 
136 aa  40.8  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  26.32 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.67 
 
 
132 aa  40.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>