52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3456 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  32.54 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  32.54 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  32.54 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  32.54 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  34.35 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  32.84 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  31.43 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  30.36 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  34.21 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  30.36 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.84 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  30.36 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  29.55 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  32.52 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  30.7 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  27.42 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  27.41 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  30.6 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  27.61 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  30.4 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  32.2 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  28.93 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  27.13 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  28.32 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.56 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  25.42 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  27.61 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  21.05 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  31.62 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  21.9 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  25.76 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  25.26 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  29.82 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  25.18 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  28.12 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  26.72 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  24.26 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  26.43 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  24.81 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  24.81 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0615  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0613  hypothetical protein  31.03 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.764284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0610  hypothetical protein  31.52 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  25.71 
 
 		 136 aa  42  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  31.15 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  25.95 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  25 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  28.71 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>