52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3366 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  273  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  42.19 
 
 
145 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  36.89 
 
 
148 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  33.81 
 
 
142 aa  87  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  39.13 
 
 
135 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  31.88 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  31.91 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  33.59 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  30.88 
 
 
136 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  31.58 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  30.77 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  32.76 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.58 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  29.91 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  29.91 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  34.11 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  28.37 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  28.87 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.88 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  33.88 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  26.43 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  31.82 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.15 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  32.59 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  28.87 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  30.77 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  31.19 
 
 
166 aa  62  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  27.61 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  26.52 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  31.15 
 
 
159 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  26.21 
 
 
160 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.23 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  25.41 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  29.31 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  24.14 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  27.66 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  21.97 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  26.56 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  27.2 
 
 
157 aa  51.2  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1335  hypothetical protein  24.14 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0885608  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  28.45 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  27.97 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  22.7 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  26.15 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  27.62 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  25 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  27.27 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  22.06 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>