39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003638 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  68.71 
 
 
159 aa  217  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  42 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  40.67 
 
 
166 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  32.38 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  32 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  29.82 
 
 
145 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  29.82 
 
 
145 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  29.82 
 
 
145 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  29.82 
 
 
145 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  28.81 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  41.11 
 
 
135 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  29.73 
 
 
141 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  27.05 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  29.63 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.52 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  30.93 
 
 
141 aa  54.3  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  26.67 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  25 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  25.93 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  29.17 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  25 
 
 
131 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  24.63 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.03 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  28.43 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  32.47 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  31.71 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  27.84 
 
 
135 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  29.79 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  28.7 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  30.43 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  27.78 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  24.79 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  24.24 
 
 
136 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  26.26 
 
 
136 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  27.14 
 
 
136 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  26.09 
 
 
138 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  27.14 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  28.99 
 
 
136 aa  41.2  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>