67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01220 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  100 
 
 
139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  49.6 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  50 
 
 
135 aa  137  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  47.83 
 
 
137 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  46.21 
 
 
136 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  45.93 
 
 
145 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  45.93 
 
 
145 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  45.93 
 
 
145 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  45.93 
 
 
145 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  43.75 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  46.22 
 
 
136 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  46.22 
 
 
136 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  45.38 
 
 
136 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  42.42 
 
 
135 aa  120  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  41.73 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  40.5 
 
 
136 aa  110  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  42.75 
 
 
131 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  41.44 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  38.17 
 
 
143 aa  93.6  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  41.74 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.82 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  34.35 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  33.88 
 
 
145 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  36.27 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  30.56 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  35.48 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  31.54 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  33.04 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  30.43 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  30.51 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  29.57 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  30.71 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  27.96 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  30.08 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1335  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0885608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  23.02 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  31.65 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  27.35 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  26.14 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  33.05 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  24.76 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  30.4 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  29.06 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  28.71 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  27.97 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  27.73 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  29.03 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  30.77 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  27.03 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  27.59 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0615  hypothetical protein  27.62 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  26.36 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  27.84 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0613  hypothetical protein  25 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.764284  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  25.18 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  35.29 
 
 
283 aa  47.8  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  31.93 
 
 
272 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  16.91 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0570  hypothetical protein  24.19 
 
 
134 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  24 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0610  hypothetical protein  26.44 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  27.43 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0950  hypothetical protein  37.21 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000580743  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  22.06 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  29.91 
 
 
381 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3503  phosphate binding protein  25.64 
 
 
286 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>