55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1598 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  100 
 
 		 132 aa  261  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  73.48 
 
 		 131 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  55.08 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  42.54 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  42.65 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  43.48 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  43.22 
 
 		 141 aa  97.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  42.61 
 
 		 136 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  39.55 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  43.48 
 
 		 136 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  40.46 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  41.22 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  41.22 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  41.22 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  41.22 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  40.91 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  37.31 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  36.57 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  35.65 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  37.88 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  36.51 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  39.82 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.77 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  30.36 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  33.88 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  22.79 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  25.41 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  23.48 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  28.21 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  26.56 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  21.32 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  20.86 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  25.19 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  25.86 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  25 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  24.06 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  25.51 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  25.4 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  28 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  25.36 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  26.72 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  26 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  29.35 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  27.05 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  30.77 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  31.58 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  35.85 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  25.93 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1335  hypothetical protein  25.4 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0885608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  23.58 
 
 		 146 aa  43.5  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  26.8 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0613  hypothetical protein  33.64 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.764284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  20.95 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  18.87 
 
 		 157 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>