48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4505 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  273  7e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  35.77 
 
 
146 aa  93.6  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  38.02 
 
 
146 aa  92  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  36.36 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  33.81 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  33.81 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  33.81 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.15 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  33.81 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  38.46 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  35 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  31.85 
 
 
136 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  32.17 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  32.06 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  29.63 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  33.08 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  34.33 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  32.46 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  32.46 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  29.31 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  34.21 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.33 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  35.25 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  29.1 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  25 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  29.82 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  25.62 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  28.43 
 
 
146 aa  52  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  25.38 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  30.16 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  24.22 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0613  hypothetical protein  25.21 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.764284  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  31.09 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.33 
 
 
139 aa  47  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  23.58 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  21.9 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0610  hypothetical protein  24.44 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0950  hypothetical protein  29.69 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000580743  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  36.36 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3451  extracellular solute-binding protein, family 1  29.31 
 
 
245 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  31.93 
 
 
272 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  20.51 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  31.15 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  33.06 
 
 
272 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  32.73 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>