31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3229 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  60 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  57.25 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0570  hypothetical protein  47.15 
 
 		 134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  43.28 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  43.75 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  39.6 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  44 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  39.6 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0950  hypothetical protein  43.59 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000580743  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.87 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  31 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  31.31 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  30.33 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  30.33 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  30.33 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  30.33 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  29.7 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  29.51 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  29.03 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  30.68 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  27.2 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  32.43 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  28.7 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  28.87 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  24.8 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  30.95 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  35.85 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  47.5 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>