42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1149 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  312  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  57.72 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  43.28 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  48.51 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  43.28 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  43.86 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  46 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  41.27 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0570  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  95.5  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0950  hypothetical protein  50.62 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000580743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  30.07 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.7 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.67 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  29.66 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  27.56 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  29.66 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  29.66 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  29.66 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  29.82 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  27.83 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  30.39 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  31.3 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  28.47 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  30.69 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  27.72 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  30.69 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  28.68 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  29.7 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  28.71 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  27.16 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  24.06 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  25.89 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  25.84 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  24.63 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  26.72 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  25.58 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  27.27 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  26.44 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  20.59 
 
 		 139 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  28.71 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  24.62 
 
 		 138 aa  41.2  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>