36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3097 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  31.13 
 
 		 136 aa  67  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  30.19 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  31.13 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  31.13 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  31.19 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  34.31 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  31.37 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  30.36 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  31.43 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.81 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.71 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  29.25 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  35 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  27.68 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  29.9 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  27.68 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  26.83 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  26.83 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  26.83 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  29.82 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.62 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  26.83 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  29.41 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  36.36 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  29.63 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  30.95 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  29.41 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  27.66 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  27.38 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0570  hypothetical protein  29.21 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  31.25 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0950  hypothetical protein  27.91 
 
 		 119 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000580743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  28.57 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  26.51 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>