40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00063 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  323  5e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  47.12 
 
 
139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  46 
 
 
153 aa  99  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  41.18 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  44.44 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  36.22 
 
 
149 aa  94.7  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  44 
 
 
146 aa  94  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0950  hypothetical protein  48.24 
 
 
119 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000580743  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0570  hypothetical protein  39.05 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  34.31 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  27.89 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  27.94 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  27.73 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  30.28 
 
 
143 aa  54.3  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  26.92 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  24.26 
 
 
145 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  24.26 
 
 
145 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  24.26 
 
 
145 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  24.26 
 
 
145 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  21.43 
 
 
131 aa  50.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  26.36 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  24 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  21.9 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  24.41 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  25.41 
 
 
136 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  25.19 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  27.93 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  25.96 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  22 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  22.9 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  24.81 
 
 
141 aa  44.3  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  26.67 
 
 
145 aa  43.9  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  24.71 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  24.47 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  25 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  23.81 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  21.6 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  25.84 
 
 
139 aa  41.2  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  20.21 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  21.1 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>