26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0615 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0615  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  271  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0613  hypothetical protein  81.02 
 
 
137 aa  206  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.764284  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0610  hypothetical protein  86.81 
 
 
137 aa  170  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  33.06 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  26.83 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  28.12 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  29.07 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  30.21 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  28.12 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  24.24 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  26.23 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  25.81 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  29.73 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  27.59 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  26.42 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  26.42 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  31.82 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  24.79 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  24.79 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  26.42 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  24.79 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  24.79 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  25.41 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  31.17 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  28.87 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  25.29 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>