44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2307 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  96.03 
 
 
252 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  96.03 
 
 
252 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  95.24 
 
 
252 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  77.51 
 
 
251 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  76.31 
 
 
251 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  76.31 
 
 
251 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2049  hypothetical protein  81.75 
 
 
254 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366069  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2172  permease  94.64 
 
 
177 aa  308  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0188  permease  55.03 
 
 
197 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1760  permease  53.3 
 
 
251 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  46.49 
 
 
256 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  42.98 
 
 
246 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  37.96 
 
 
257 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  38.52 
 
 
253 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  37.5 
 
 
256 aa  138  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2536  hypothetical protein  43.69 
 
 
115 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.320016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  29.15 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0623  hypothetical protein  30.49 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0601  hypothetical protein  27.78 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105908  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0833  hypothetical protein  28.14 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.977208  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  25.13 
 
 
220 aa  58.5  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  28.27 
 
 
273 aa  52  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  25.22 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  31.03 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  23.98 
 
 
344 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  31.03 
 
 
240 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  24.8 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  26.67 
 
 
255 aa  49.3  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  29.89 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  25.91 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  23.51 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2535  hypothetical protein  37.29 
 
 
59 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.308945 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  24.34 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  27.47 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  26.32 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  30.68 
 
 
241 aa  45.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  23.81 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  24.45 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  42.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  26.98 
 
 
245 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  26.98 
 
 
245 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  26.78 
 
 
252 aa  42  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  26.98 
 
 
245 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>