36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1985 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  100 
 
 		 771 aa  1582    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  84.05 
 
 		 771 aa  1347    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  41.19 
 
 		 818 aa  596  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  40.89 
 
 		 767 aa  591  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  41.06 
 
 		 767 aa  589  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  27.94 
 
 		 792 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  27.19 
 
 		 753 aa  252  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  27.25 
 
 		 776 aa  179  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  27.81 
 
 		 810 aa  179  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  23.67 
 
 		 792 aa  171  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  24.1 
 
 		 722 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  25.85 
 
 		 803 aa  158  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1488  hypothetical protein  39.13 
 
 		 144 aa  89.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.016792  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  23 
 
 		 743 aa  85.9  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  22.51 
 
 		 710 aa  81.6  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  25 
 
 		 717 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  26.39 
 
 		 643 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  34 
 
 		 743 aa  68.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  28.4 
 
 		 757 aa  67.8  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  31.73 
 
 		 770 aa  60.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  24.19 
 
 		 746 aa  58.5  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  24.82 
 
 		 721 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  27.57 
 
 		 895 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  23.63 
 
 		 878 aa  50.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  20.75 
 
 		 844 aa  50.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0699  hypothetical protein  36.11 
 
 		 76 aa  48.9  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  26.14 
 
 		 868 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4596  hypothetical protein  25.95 
 
 		 728 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.654413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  33.7 
 
 		 874 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1086  anticodon nuclease  31.03 
 
 		 383 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.028273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0809  hypothetical protein  24.68 
 
 		 703 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000260576 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3325  hypothetical protein  29.49 
 
 		 763 aa  45.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  22.52 
 
 		 849 aa  44.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  32.18 
 
 		 796 aa  44.3  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3111  hypothetical protein  25 
 
 		 765 aa  44.3  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  28.42 
 
 		 873 aa  44.3  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>