More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3903 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 509 aa  1010    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.57 
 
 		 507 aa  544  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.503144  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1852  multidrug resistance transmembrane protein  46.71 
 
 		 512 aa  445  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119423 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3117  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.41 
 
 		 516 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1022  multidrug resistance protein VceB  43.29 
 
 		 511 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.45 
 
 		 520 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.65 
 
 		 520 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4220  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.43 
 
 		 510 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663619  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.02 
 
 		 520 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.41 
 
 		 520 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.01 
 
 		 520 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.41 
 
 		 520 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.01 
 
 		 520 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  38.26 
 
 		 518 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.13 
 
 		 520 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  39.71 
 
 		 519 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.01 
 
 		 520 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.54 
 
 		 511 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.63 
 
 		 519 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.63 
 
 		 519 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.63 
 
 		 519 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.63 
 
 		 519 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.63 
 
 		 519 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.54 
 
 		 520 aa  364  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  39.59 
 
 		 512 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.63 
 
 		 519 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.63 
 
 		 519 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.63 
 
 		 519 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.63 
 
 		 519 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.88 
 
 		 544 aa  362  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.55 
 
 		 520 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497968 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  40.12 
 
 		 511 aa  362  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.12 
 
 		 511 aa  362  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  40.12 
 
 		 511 aa  362  8e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  39.3 
 
 		 512 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.12 
 
 		 511 aa  361  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  39.09 
 
 		 512 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  39.09 
 
 		 512 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.23 
 
 		 519 aa  359  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.87 
 
 		 518 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.87 
 
 		 518 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.23 
 
 		 519 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.23 
 
 		 519 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.24 
 
 		 517 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.23 
 
 		 519 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.81 
 
 		 513 aa  356  5.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.92 
 
 		 511 aa  355  8.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.28 
 
 		 509 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.68 
 
 		 520 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.15 
 
 		 510 aa  355  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.8 
 
 		 520 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.4 
 
 		 527 aa  354  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  39.3 
 
 		 512 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0252817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.97 
 
 		 515 aa  352  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40 
 
 		 531 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.59 
 
 		 494 aa  351  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.8 
 
 		 523 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.8 
 
 		 523 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.61 
 
 		 537 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.89 
 
 		 520 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  38.97 
 
 		 512 aa  350  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  38.97 
 
 		 512 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.97 
 
 		 512 aa  350  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  38.97 
 
 		 512 aa  350  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  38.97 
 
 		 512 aa  350  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.97 
 
 		 512 aa  350  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  38.97 
 
 		 512 aa  350  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  38.97 
 
 		 512 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.99 
 
 		 520 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.99 
 
 		 520 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.29 
 
 		 524 aa  348  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.98 
 
 		 511 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.79 
 
 		 520 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.15 
 
 		 522 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.79 
 
 		 520 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.69 
 
 		 511 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.35 
 
 		 522 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135195 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.79 
 
 		 520 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.82 
 
 		 519 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  38.01 
 
 		 528 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  38.01 
 
 		 528 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.01 
 
 		 527 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.62 
 
 		 519 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  38.01 
 
 		 528 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.01 
 
 		 527 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.01 
 
 		 528 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0322  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.34 
 
 		 522 aa  347  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516199 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.01 
 
 		 528 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.2 
 
 		 577 aa  347  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  38.01 
 
 		 528 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  38.01 
 
 		 528 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.01 
 
 		 528 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.37 
 
 		 518 aa  346  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  38.01 
 
 		 528 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.01 
 
 		 528 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.01 
 
 		 528 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  38.01 
 
 		 528 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.4 
 
 		 511 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.4 
 
 		 511 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.41 
 
 		 521 aa  345  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.477871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>