44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2881 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  315  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  39.52 
 
 
141 aa  103  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  35.25 
 
 
174 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  39.13 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  37.1 
 
 
174 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  37.1 
 
 
174 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  39.39 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  39.39 
 
 
158 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  39.39 
 
 
158 aa  94.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  35.94 
 
 
175 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  42.45 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  44.55 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  44.55 
 
 
157 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  44.55 
 
 
157 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  44.55 
 
 
162 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  43.56 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  34.48 
 
 
155 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  37.1 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  39.83 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  38.79 
 
 
155 aa  84  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  42.57 
 
 
162 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  34.86 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  40.21 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  32.45 
 
 
133 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  32.11 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  33.98 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4696  hypothetical protein  29.13 
 
 
122 aa  67  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0528913  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  36.46 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  31.03 
 
 
253 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  30.71 
 
 
253 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  33.33 
 
 
276 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  32.81 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  29.08 
 
 
288 aa  57.8  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  27.87 
 
 
247 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  28.57 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  27.64 
 
 
255 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  28.79 
 
 
288 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  24.62 
 
 
254 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  32.38 
 
 
255 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  30.09 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  27.14 
 
 
287 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  27.91 
 
 
287 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  32.95 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  30.23 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>