More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3444 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
716 aa  1402    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  80.11 
 
 
716 aa  1072    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.12 
 
 
677 aa  547  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  38.64 
 
 
727 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  39.07 
 
 
653 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  42.08 
 
 
670 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  39.97 
 
 
638 aa  364  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.46 
 
 
702 aa  362  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.41 
 
 
583 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.96 
 
 
655 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  38.03 
 
 
839 aa  343  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.56 
 
 
607 aa  337  5e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  38.1 
 
 
586 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.95 
 
 
635 aa  320  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.79 
 
 
682 aa  306  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  37.25 
 
 
708 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 
654 aa  301  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  34.63 
 
 
635 aa  301  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 
642 aa  300  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.84 
 
 
657 aa  300  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 
642 aa  300  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 
642 aa  300  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.26 
 
 
663 aa  298  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  37.05 
 
 
711 aa  298  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.47 
 
 
581 aa  296  6e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  34.35 
 
 
652 aa  296  8e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.1 
 
 
662 aa  295  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  34.55 
 
 
657 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  34.7 
 
 
577 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 
657 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.75 
 
 
637 aa  285  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  34.8 
 
 
679 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 
570 aa  283  9e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.21 
 
 
618 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.34 
 
 
754 aa  281  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  35.56 
 
 
656 aa  279  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.38 
 
 
654 aa  279  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  35.42 
 
 
594 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.42 
 
 
594 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 
705 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  33.39 
 
 
682 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
582 aa  270  7e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.6 
 
 
692 aa  270  8e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 
600 aa  269  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  33.51 
 
 
695 aa  269  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.6 
 
 
570 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  34.67 
 
 
660 aa  268  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.48 
 
 
672 aa  267  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.6 
 
 
553 aa  267  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  35.47 
 
 
583 aa  266  8e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 
634 aa  266  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  32.75 
 
 
729 aa  266  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  33.51 
 
 
740 aa  265  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  34.81 
 
 
657 aa  264  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
578 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 
588 aa  263  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.44 
 
 
635 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 
584 aa  262  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  34.21 
 
 
614 aa  261  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 
616 aa  261  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  34.21 
 
 
614 aa  260  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  34.21 
 
 
614 aa  260  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  34.21 
 
 
614 aa  260  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  34.21 
 
 
614 aa  260  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  34.21 
 
 
614 aa  260  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  34.21 
 
 
614 aa  260  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1250  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.65 
 
 
592 aa  260  8e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0497738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 
615 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 
615 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 
615 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
613 aa  258  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
583 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 
615 aa  257  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.34 
 
 
703 aa  257  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
613 aa  256  7e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  32.88 
 
 
615 aa  256  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  32.43 
 
 
614 aa  256  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.62 
 
 
582 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  33.68 
 
 
614 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  34.63 
 
 
624 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09550  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.83 
 
 
581 aa  254  3e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.102088 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  33.22 
 
 
595 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  33.67 
 
 
621 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 
680 aa  254  6e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2100  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 
568 aa  253  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000215244 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  33.05 
 
 
615 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 
580 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  33.16 
 
 
645 aa  252  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  33.1 
 
 
622 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  35.45 
 
 
575 aa  252  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
582 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  31.35 
 
 
713 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.79 
 
 
619 aa  251  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  31.87 
 
 
579 aa  251  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.81 
 
 
708 aa  251  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 
582 aa  250  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  33.75 
 
 
582 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 
614 aa  250  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  32.4 
 
 
581 aa  250  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  32.08 
 
 
579 aa  250  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>