110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2231 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  94.87 
 
 
79 aa  154  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  67.57 
 
 
80 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  62.82 
 
 
78 aa  103  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  59.49 
 
 
78 aa  100  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  65.38 
 
 
80 aa  100  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  64.38 
 
 
77 aa  100  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  61.54 
 
 
78 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  62.82 
 
 
77 aa  97.1  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  71.43 
 
 
76 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  61.54 
 
 
78 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  58.9 
 
 
77 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  63.01 
 
 
78 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  57.33 
 
 
95 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  55.26 
 
 
82 aa  84  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  64.52 
 
 
69 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  54.79 
 
 
103 aa  77  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  58.33 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  51.61 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  53.12 
 
 
67 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  49.23 
 
 
77 aa  63.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  45.71 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  46.15 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  45.71 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  53.33 
 
 
80 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  44.62 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  52.38 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  48.44 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  45.31 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  43.55 
 
 
69 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  40.54 
 
 
76 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6312  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 
74 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61619  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  42.86 
 
 
64 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  46.97 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  36.14 
 
 
127 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  46.67 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  50.82 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  45.31 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  42.65 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  40.32 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  43.75 
 
 
72 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  43.28 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  36 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  46.43 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  44.83 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  43.1 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  46.55 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  41.38 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  37.7 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  38.46 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  41.89 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  40.62 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  47.62 
 
 
57 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  44.26 
 
 
65 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  45.76 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  36.92 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  43.64 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  40.82 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  47.92 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  39.68 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  36.76 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  42.37 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  42.37 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2128  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  38.24 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  43.28 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  39.73 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  41.38 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  39.06 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  45.1 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  38.71 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  48.94 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  49.09 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  34.92 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  38.46 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  40 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0787  hypothetical protein  38.98 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679584  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  37.88 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0413  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  37.5 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  35.53 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  41.67 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  28 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  36.21 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  37.7 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  47.83 
 
 
62 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  38.71 
 
 
62 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 
82 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  44.9 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 
139 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  48.94 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  42.86 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  44.64 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>