76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1597 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  35.87 
 
 		 1028 aa  636    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  100 
 
 		 1042 aa  2149    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  28.25 
 
 		 672 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  29.35 
 
 		 672 aa  260  8e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  28.92 
 
 		 856 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  24.88 
 
 		 840 aa  240  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  27.81 
 
 		 673 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  29.54 
 
 		 658 aa  230  9e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  26.72 
 
 		 898 aa  228  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  28.27 
 
 		 684 aa  189  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  27.72 
 
 		 704 aa  110  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0134  hypothetical protein  23.23 
 
 		 667 aa  105  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0021689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1568  hypothetical protein  22.38 
 
 		 673 aa  102  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1433 aa  97.8  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  25.66 
 
 		 1225 aa  96.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1433 aa  97.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  26.25 
 
 		 1431 aa  95.5  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  27.19 
 
 		 637 aa  94.7  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  27.19 
 
 		 637 aa  94.7  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  25.43 
 
 		 647 aa  93.6  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  26.85 
 
 		 636 aa  91.7  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  26.85 
 
 		 636 aa  90.9  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  26.7 
 
 		 664 aa  90.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 1096 aa  89  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  24.77 
 
 		 647 aa  89  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  21.51 
 
 		 633 aa  84.7  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 		 1338 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  27.6 
 
 		 616 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  25.88 
 
 		 633 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  25.78 
 
 		 634 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  23.16 
 
 		 753 aa  72.4  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  24.26 
 
 		 633 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  26.64 
 
 		 659 aa  70.1  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  25.78 
 
 		 634 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  31.41 
 
 		 624 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  23.12 
 
 		 635 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  29.32 
 
 		 624 aa  68.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  23.03 
 
 		 641 aa  68.2  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  24.3 
 
 		 638 aa  68.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  45.57 
 
 		 342 aa  67.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  23.99 
 
 		 638 aa  65.1  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 1253 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0647  hypothetical protein  29.66 
 
 		 194 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  26.48 
 
 		 647 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  26.48 
 
 		 647 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0620  hypothetical protein  29.66 
 
 		 194 aa  63.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  22.1 
 
 		 1257 aa  63.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  29.5 
 
 		 1256 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.86 
 
 		 1256 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4278  hypothetical protein  25.44 
 
 		 200 aa  60.1  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.86 
 
 		 1256 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3589  hypothetical protein  29.66 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.348708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1361  hypothetical protein  35.29 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  22.8 
 
 		 632 aa  55.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  32.38 
 
 		 639 aa  55.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0238  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1239 aa  54.7  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  24.32 
 
 		 632 aa  54.7  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0249  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1238 aa  54.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.868724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0260  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1238 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1175  hypothetical protein  32.91 
 
 		 198 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  20.92 
 
 		 613 aa  52.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  20.92 
 
 		 613 aa  52.4  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3019  hypothetical protein  29.67 
 
 		 191 aa  52.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0534  hypothetical protein  36.11 
 
 		 197 aa  51.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  28.67 
 
 		 642 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4243  hypothetical protein  35.82 
 
 		 206 aa  48.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  25.17 
 
 		 621 aa  47.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  21.36 
 
 		 637 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  31.62 
 
 		 637 aa  45.8  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49810  hypothetical protein  30 
 
 		 195 aa  45.8  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  25.5 
 
 		 636 aa  45.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  35.96 
 
 		 626 aa  45.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  35.96 
 
 		 629 aa  44.7  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  35.96 
 
 		 626 aa  44.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  35.96 
 
 		 626 aa  44.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  35.96 
 
 		 632 aa  44.7  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>