More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2713 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  100 
 
 		 274 aa  532  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2529  HemK family modification methylase  59.53 
 
 		 274 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.677433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0287  HemK family modification methylase  51.48 
 
 		 291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.85 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  45.68 
 
 		 317 aa  191  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  45.99 
 
 		 291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  43.43 
 
 		 295 aa  185  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.18 
 
 		 295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.07 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  46.55 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  43.23 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.91 
 
 		 306 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  41.92 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.97 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  46.81 
 
 		 319 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  43.19 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.29 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  40 
 
 		 289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  44.73 
 
 		 289 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  43.87 
 
 		 281 aa  162  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  42.52 
 
 		 299 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  42.59 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  44.02 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  39.78 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  41.06 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.87 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  41.7 
 
 		 292 aa  158  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  44.05 
 
 		 280 aa  158  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  44.14 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  39.29 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  40.51 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  39.05 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  43.68 
 
 		 294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  44.96 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  38.73 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.31 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.53 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  39.85 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  43.65 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  39.77 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.15 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  40.58 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.89 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  42.23 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  36.15 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  36.13 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  38.85 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  43.46 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  43.17 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  45 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.55 
 
 		 296 aa  148  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1015  HemK family modification methylase  48.91 
 
 		 280 aa  148  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.83 
 
 		 296 aa  148  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  36.78 
 
 		 279 aa  148  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  41.73 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  35.19 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  33.7 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  43.41 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  39.19 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  36 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  39.91 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  39.29 
 
 		 279 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.23 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.12 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  39.92 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  40.87 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.21 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  35.23 
 
 		 283 aa  145  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  43.58 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  35.47 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  36.46 
 
 		 284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  39.51 
 
 		 283 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.7 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0010  HemK family modification methylase  33.57 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.175416  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  38.7 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.38 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  43.53 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  39.29 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  42.49 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  33.82 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  33.82 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  37.04 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  44.71 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  34.94 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  34.73 
 
 		 289 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  38.02 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  40.3 
 
 		 284 aa  142  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  35.38 
 
 		 288 aa  141  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  35.93 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  36.26 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  31.52 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.83 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.03 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  38.76 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  35.53 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  41.2 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  41.7 
 
 		 285 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1063  HemK family modification methylase  32.69 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.77 
 
 		 276 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  35.53 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>