56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1760 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  100 
 
 		 149 aa  295  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  51.7 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  40.4 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  41.72 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  39.07 
 
 		 150 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  39.07 
 
 		 150 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  40.13 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  39.74 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1228  DNA polymerase III subunit chi  38.78 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.022673  normal  0.528347 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0681  DNA polymerase III subunit chi  33.56 
 
 		 149 aa  84.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0690  DNA polymerase III subunit chi  33.56 
 
 		 149 aa  84.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.435685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  37.75 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  37.5 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  35.33 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  33.11 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2898  DNA polymerase III subunit chi  35.53 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  36.49 
 
 		 172 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3053  DNA polymerase III subunit chi  42.11 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00465951  normal  0.254761 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0951  DNA polymerase III subunit chi  36.84 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  35.86 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  34 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0649  DNA polymerase III chi subunit HolC  33.11 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  34 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  34.44 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0509  DNA polymerase III subunit chi  28 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  32.67 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1542  DNA polymerase III subunit chi  36.05 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  33.33 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  32.67 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1192  DNA polymerase III subunit chi  32.24 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.369571  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  32 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  32 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0767  DNA polymerase III subunit chi  31.33 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0904  DNA polymerase III subunit chi  35.1 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.0444908 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  31.76 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  35.43 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  33.33 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1123  DNA polymerase III subunit chi  34.01 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  30.34 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1816  DNA polymerase III subunit chi  31.58 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2806  DNA polymerase III subunit chi  36.14 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.654553  normal  0.315604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2682  DNA polymerase III subunit chi  34.94 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0568608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0223  DNA polymerase III, chi subunit  33.33 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000247187  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1548  DNA polymerase III, chi subunit  28.44 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2411  DNA polymerase III subunit chi  35.86 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3637  DNA polymerase III subunit chi  34.94 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  32.05 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2788  DNA polymerase III chi subunit HolC  34.04 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0985  DNA polymerase III subunit chi  34.94 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0286  DNA polymerase III, chi subunit  32.39 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1270  DNA polymerase III, chi subunit  34.91 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11640  DNA polymerase III subunit chi  39.06 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3083  DNA polymerase III chi subunit, HolC  33.73 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0988  DNA polymerase III subunit chi  35.62 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3649  DNA polymerase III subunit chi  33.8 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1090  DNA polymerase III subunit chi  33.65 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>